Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0W4

NLGN4X, Neuroligin-4, X-linked, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4XQ8N0W4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLGN4XQ8N0W4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NLGN4XQ8N0W4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLGN4XQ8N0W4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLGN4XQ8N0W4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLGN4XQ8N0W4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLGN4XQ8N0W4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLGN4XQ8N0W4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLGN4XQ8N0W4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NLGN4XQ8N0W4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NLGN4XQ8N0W4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLGN4XQ8N0W4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLGN4XQ8N0W4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLGN4XQ8N0W4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLGN4XQ8N0W4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NLGN4XQ8N0W4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NLGN4XQ8N0W4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NLGN4XQ8N0W4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLGN4XQ8N0W4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLGN4XQ8N0W4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLGN4XQ8N0W4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLGN4XQ8N0W4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLGN4XQ8N0W4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLGN4XQ8N0W4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLGN4XQ8N0W4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLGN4XQ8N0W4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLGN4XQ8N0W4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLGN4XQ8N0W4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLGN4XQ8N0W4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLGN4XQ8N0W4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLGN4XQ8N0W4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLGN4XQ8N0W4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLGN4XQ8N0W4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NLGN4XQ8N0W4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NLGN4XQ8N0W4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NLGN4XQ8N0W4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NLGN4XQ8N0W4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NLGN4XQ8N0W4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NLGN4XQ8N0W4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NLGN4XQ8N0W4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NLGN4XQ8N0W4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NLGN4XQ8N0W4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NLGN4XQ8N0W4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLGN4XQ8N0W4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLGN4XQ8N0W4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NLGN4XQ8N0W4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLGN4XQ8N0W4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLGN4XQ8N0W4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLGN4XQ8N0W4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NLGN4XQ8N0W4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLGN4XQ8N0W4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLGN4XQ8N0W4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLGN4XQ8N0W4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLGN4XQ8N0W4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLGN4XQ8N0W4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLGN4XQ8N0W4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLGN4XQ8N0W4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLGN4XQ8N0W4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLGN4XQ8N0W4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLGN4XQ8N0W4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLGN4XQ8N0W4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLGN4XQ8N0W4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLGN4XQ8N0W4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLGN4XQ8N0W4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLGN4XQ8N0W4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NLGN4XQ8N0W4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLGN4XQ8N0W4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLGN4XQ8N0W4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLGN4XQ8N0W4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLGN4XQ8N0W4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLGN4XQ8N0W4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLGN4XQ8N0W4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLGN4XQ8N0W4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLGN4XQ8N0W4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLGN4XQ8N0W4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLGN4XQ8N0W4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLGN4XQ8N0W4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLGN4XQ8N0W4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLGN4XQ8N0W4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLGN4XQ8N0W4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLGN4XQ8N0W4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLGN4XQ8N0W4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLGN4XQ8N0W4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLGN4XQ8N0W4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLGN4XQ8N0W4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLGN4XQ8N0W4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLGN4XQ8N0W4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLGN4XQ8N0W4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLGN4XQ8N0W4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLGN4XQ8N0W4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLGN4XQ8N0W4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLGN4XQ8N0W4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLGN4XQ8N0W4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLGN4XQ8N0W4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLGN4XQ8N0W4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLGN4XQ8N0W4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLGN4XQ8N0W4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLGN4XQ8N0W4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLGN4XQ8N0W4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLGN4XQ8N0W4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms