Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLD3Q8IV08 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLD3Q8IV08 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLD3Q8IV08 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLD3Q8IV08 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLD3Q8IV08 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLD3Q8IV08 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLD3Q8IV08 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PLD3Q8IV08 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLD3Q8IV08 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLD3Q8IV08 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLD3Q8IV08 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLD3Q8IV08 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLD3Q8IV08 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLD3Q8IV08 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLD3Q8IV08 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLD3Q8IV08 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLD3Q8IV08 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLD3Q8IV08 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLD3Q8IV08 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLD3Q8IV08 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLD3Q8IV08 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLD3Q8IV08 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLD3Q8IV08 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLD3Q8IV08 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLD3Q8IV08 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
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PLD3Q8IV08 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
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PLD3Q8IV08 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLD3Q8IV08 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLD3Q8IV08 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLD3Q8IV08 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLD3Q8IV08 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PLD3Q8IV08 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLD3Q8IV08 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLD3Q8IV08 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLD3Q8IV08 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLD3Q8IV08 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLD3Q8IV08 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLD3Q8IV08 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLD3Q8IV08 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLD3Q8IV08 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLD3Q8IV08 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
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PLD3Q8IV08 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
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PLD3Q8IV08 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
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PLD3Q8IV08 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLD3Q8IV08 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLD3Q8IV08 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
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PLD3Q8IV08 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PLD3Q8IV08 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
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PLD3Q8IV08 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
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PLD3Q8IV08 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PLD3Q8IV08 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLD3Q8IV08 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLD3Q8IV08 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLD3Q8IV08 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
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PLD3Q8IV08 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLD3Q8IV08 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLD3Q8IV08 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PLD3Q8IV08 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLD3Q8IV08 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLD3Q8IV08 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLD3Q8IV08 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLD3Q8IV08 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLD3Q8IV08 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLD3Q8IV08 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLD3Q8IV08 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLD3Q8IV08 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLD3Q8IV08 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
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