Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMJ2

SCARA5, Scavenger receptor class A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA5Q6ZMJ2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCARA5Q6ZMJ2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCARA5Q6ZMJ2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCARA5Q6ZMJ2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCARA5Q6ZMJ2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCARA5Q6ZMJ2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCARA5Q6ZMJ2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCARA5Q6ZMJ2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCARA5Q6ZMJ2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCARA5Q6ZMJ2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCARA5Q6ZMJ2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCARA5Q6ZMJ2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCARA5Q6ZMJ2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCARA5Q6ZMJ2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCARA5Q6ZMJ2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCARA5Q6ZMJ2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCARA5Q6ZMJ2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SCARA5Q6ZMJ2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCARA5Q6ZMJ2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCARA5Q6ZMJ2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCARA5Q6ZMJ2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCARA5Q6ZMJ2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCARA5Q6ZMJ2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCARA5Q6ZMJ2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCARA5Q6ZMJ2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCARA5Q6ZMJ2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCARA5Q6ZMJ2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCARA5Q6ZMJ2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCARA5Q6ZMJ2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCARA5Q6ZMJ2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCARA5Q6ZMJ2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCARA5Q6ZMJ2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCARA5Q6ZMJ2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCARA5Q6ZMJ2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCARA5Q6ZMJ2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCARA5Q6ZMJ2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCARA5Q6ZMJ2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCARA5Q6ZMJ2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCARA5Q6ZMJ2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCARA5Q6ZMJ2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SCARA5Q6ZMJ2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCARA5Q6ZMJ2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCARA5Q6ZMJ2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCARA5Q6ZMJ2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCARA5Q6ZMJ2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCARA5Q6ZMJ2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCARA5Q6ZMJ2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCARA5Q6ZMJ2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCARA5Q6ZMJ2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCARA5Q6ZMJ2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCARA5Q6ZMJ2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCARA5Q6ZMJ2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCARA5Q6ZMJ2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCARA5Q6ZMJ2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCARA5Q6ZMJ2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCARA5Q6ZMJ2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SCARA5Q6ZMJ2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCARA5Q6ZMJ2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SCARA5Q6ZMJ2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCARA5Q6ZMJ2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCARA5Q6ZMJ2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCARA5Q6ZMJ2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCARA5Q6ZMJ2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCARA5Q6ZMJ2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCARA5Q6ZMJ2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCARA5Q6ZMJ2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCARA5Q6ZMJ2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCARA5Q6ZMJ2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
SCARA5Q6ZMJ2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCARA5Q6ZMJ2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCARA5Q6ZMJ2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCARA5Q6ZMJ2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SCARA5Q6ZMJ2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCARA5Q6ZMJ2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCARA5Q6ZMJ2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCARA5Q6ZMJ2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCARA5Q6ZMJ2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCARA5Q6ZMJ2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCARA5Q6ZMJ2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SCARA5Q6ZMJ2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCARA5Q6ZMJ2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCARA5Q6ZMJ2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCARA5Q6ZMJ2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCARA5Q6ZMJ2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCARA5Q6ZMJ2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SCARA5Q6ZMJ2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCARA5Q6ZMJ2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCARA5Q6ZMJ2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCARA5Q6ZMJ2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCARA5Q6ZMJ2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCARA5Q6ZMJ2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCARA5Q6ZMJ2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCARA5Q6ZMJ2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCARA5Q6ZMJ2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCARA5Q6ZMJ2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCARA5Q6ZMJ2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCARA5Q6ZMJ2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCARA5Q6ZMJ2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms