Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FBXO38Q6PIJ6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FBXO38Q6PIJ6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FBXO38Q6PIJ6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FBXO38Q6PIJ6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
FBXO38Q6PIJ6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FBXO38Q6PIJ6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FBXO38Q6PIJ6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FBXO38Q6PIJ6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FBXO38Q6PIJ6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FBXO38Q6PIJ6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FBXO38Q6PIJ6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FBXO38Q6PIJ6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FBXO38Q6PIJ6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FBXO38Q6PIJ6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FBXO38Q6PIJ6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FBXO38Q6PIJ6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FBXO38Q6PIJ6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FBXO38Q6PIJ6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FBXO38Q6PIJ6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXO38Q6PIJ6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXO38Q6PIJ6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXO38Q6PIJ6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXO38Q6PIJ6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FBXO38Q6PIJ6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FBXO38Q6PIJ6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FBXO38Q6PIJ6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FBXO38Q6PIJ6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FBXO38Q6PIJ6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FBXO38Q6PIJ6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FBXO38Q6PIJ6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FBXO38Q6PIJ6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FBXO38Q6PIJ6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FBXO38Q6PIJ6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FBXO38Q6PIJ6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FBXO38Q6PIJ6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FBXO38Q6PIJ6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FBXO38Q6PIJ6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FBXO38Q6PIJ6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FBXO38Q6PIJ6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FBXO38Q6PIJ6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FBXO38Q6PIJ6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FBXO38Q6PIJ6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FBXO38Q6PIJ6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FBXO38Q6PIJ6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FBXO38Q6PIJ6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FBXO38Q6PIJ6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FBXO38Q6PIJ6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FBXO38Q6PIJ6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FBXO38Q6PIJ6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FBXO38Q6PIJ6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FBXO38Q6PIJ6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FBXO38Q6PIJ6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FBXO38Q6PIJ6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FBXO38Q6PIJ6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FBXO38Q6PIJ6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FBXO38Q6PIJ6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
FBXO38Q6PIJ6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FBXO38Q6PIJ6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FBXO38Q6PIJ6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FBXO38Q6PIJ6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FBXO38Q6PIJ6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FBXO38Q6PIJ6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FBXO38Q6PIJ6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FBXO38Q6PIJ6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FBXO38Q6PIJ6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FBXO38Q6PIJ6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FBXO38Q6PIJ6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FBXO38Q6PIJ6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FBXO38Q6PIJ6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FBXO38Q6PIJ6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FBXO38Q6PIJ6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FBXO38Q6PIJ6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FBXO38Q6PIJ6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FBXO38Q6PIJ6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FBXO38Q6PIJ6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FBXO38Q6PIJ6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FBXO38Q6PIJ6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FBXO38Q6PIJ6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FBXO38Q6PIJ6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FBXO38Q6PIJ6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FBXO38Q6PIJ6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FBXO38Q6PIJ6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FBXO38Q6PIJ6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FBXO38Q6PIJ6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FBXO38Q6PIJ6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FBXO38Q6PIJ6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FBXO38Q6PIJ6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FBXO38Q6PIJ6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FBXO38Q6PIJ6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FBXO38Q6PIJ6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FBXO38Q6PIJ6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FBXO38Q6PIJ6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FBXO38Q6PIJ6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FBXO38Q6PIJ6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FBXO38Q6PIJ6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FBXO38Q6PIJ6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FBXO38Q6PIJ6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FBXO38Q6PIJ6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FBXO38Q6PIJ6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms