Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NCAPH2Q6IBW4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NCAPH2Q6IBW4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NCAPH2Q6IBW4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NCAPH2Q6IBW4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NCAPH2Q6IBW4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NCAPH2Q6IBW4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NCAPH2Q6IBW4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NCAPH2Q6IBW4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NCAPH2Q6IBW4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NCAPH2Q6IBW4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NCAPH2Q6IBW4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NCAPH2Q6IBW4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NCAPH2Q6IBW4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCAPH2Q6IBW4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCAPH2Q6IBW4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCAPH2Q6IBW4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCAPH2Q6IBW4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCAPH2Q6IBW4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NCAPH2Q6IBW4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCAPH2Q6IBW4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NCAPH2Q6IBW4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NCAPH2Q6IBW4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NCAPH2Q6IBW4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NCAPH2Q6IBW4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NCAPH2Q6IBW4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCAPH2Q6IBW4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCAPH2Q6IBW4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCAPH2Q6IBW4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCAPH2Q6IBW4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCAPH2Q6IBW4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NCAPH2Q6IBW4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NCAPH2Q6IBW4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NCAPH2Q6IBW4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCAPH2Q6IBW4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCAPH2Q6IBW4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCAPH2Q6IBW4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NCAPH2Q6IBW4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NCAPH2Q6IBW4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NCAPH2Q6IBW4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NCAPH2Q6IBW4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NCAPH2Q6IBW4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCAPH2Q6IBW4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCAPH2Q6IBW4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCAPH2Q6IBW4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NCAPH2Q6IBW4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NCAPH2Q6IBW4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NCAPH2Q6IBW4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NCAPH2Q6IBW4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NCAPH2Q6IBW4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NCAPH2Q6IBW4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NCAPH2Q6IBW4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms