Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF220Q5VTB9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF220Q5VTB9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF220Q5VTB9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF220Q5VTB9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF220Q5VTB9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF220Q5VTB9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF220Q5VTB9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF220Q5VTB9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF220Q5VTB9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF220Q5VTB9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF220Q5VTB9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF220Q5VTB9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF220Q5VTB9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF220Q5VTB9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF220Q5VTB9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF220Q5VTB9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF220Q5VTB9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF220Q5VTB9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF220Q5VTB9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF220Q5VTB9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF220Q5VTB9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF220Q5VTB9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF220Q5VTB9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF220Q5VTB9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF220Q5VTB9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF220Q5VTB9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF220Q5VTB9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF220Q5VTB9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF220Q5VTB9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF220Q5VTB9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF220Q5VTB9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF220Q5VTB9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF220Q5VTB9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF220Q5VTB9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF220Q5VTB9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF220Q5VTB9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF220Q5VTB9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF220Q5VTB9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF220Q5VTB9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF220Q5VTB9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF220Q5VTB9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF220Q5VTB9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF220Q5VTB9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF220Q5VTB9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF220Q5VTB9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF220Q5VTB9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF220Q5VTB9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF220Q5VTB9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF220Q5VTB9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF220Q5VTB9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF220Q5VTB9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF220Q5VTB9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF220Q5VTB9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF220Q5VTB9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF220Q5VTB9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF220Q5VTB9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF220Q5VTB9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF220Q5VTB9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF220Q5VTB9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF220Q5VTB9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF220Q5VTB9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF220Q5VTB9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF220Q5VTB9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF220Q5VTB9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF220Q5VTB9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF220Q5VTB9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF220Q5VTB9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF220Q5VTB9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF220Q5VTB9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF220Q5VTB9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF220Q5VTB9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF220Q5VTB9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF220Q5VTB9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF220Q5VTB9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF220Q5VTB9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF220Q5VTB9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF220Q5VTB9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF220Q5VTB9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF220Q5VTB9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF220Q5VTB9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF220Q5VTB9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF220Q5VTB9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF220Q5VTB9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF220Q5VTB9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF220Q5VTB9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF220Q5VTB9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF220Q5VTB9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF220Q5VTB9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF220Q5VTB9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF220Q5VTB9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF220Q5VTB9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF220Q5VTB9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF220Q5VTB9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF220Q5VTB9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF220Q5VTB9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF220Q5VTB9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF220Q5VTB9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF220Q5VTB9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RNF220Q5VTB9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms