Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYTL3Q4VX76 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SYTL3Q4VX76 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYTL3Q4VX76 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYTL3Q4VX76 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYTL3Q4VX76 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYTL3Q4VX76 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYTL3Q4VX76 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYTL3Q4VX76 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYTL3Q4VX76 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYTL3Q4VX76 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYTL3Q4VX76 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYTL3Q4VX76 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYTL3Q4VX76 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYTL3Q4VX76 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYTL3Q4VX76 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYTL3Q4VX76 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYTL3Q4VX76 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYTL3Q4VX76 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYTL3Q4VX76 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYTL3Q4VX76 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYTL3Q4VX76 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYTL3Q4VX76 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYTL3Q4VX76 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYTL3Q4VX76 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYTL3Q4VX76 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SYTL3Q4VX76 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYTL3Q4VX76 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SYTL3Q4VX76 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYTL3Q4VX76 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYTL3Q4VX76 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYTL3Q4VX76 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYTL3Q4VX76 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYTL3Q4VX76 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYTL3Q4VX76 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYTL3Q4VX76 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYTL3Q4VX76 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYTL3Q4VX76 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SYTL3Q4VX76 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYTL3Q4VX76 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYTL3Q4VX76 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYTL3Q4VX76 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYTL3Q4VX76 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYTL3Q4VX76 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SYTL3Q4VX76 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYTL3Q4VX76 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYTL3Q4VX76 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYTL3Q4VX76 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYTL3Q4VX76 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SYTL3Q4VX76 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYTL3Q4VX76 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYTL3Q4VX76 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYTL3Q4VX76 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYTL3Q4VX76 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYTL3Q4VX76 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYTL3Q4VX76 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYTL3Q4VX76 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYTL3Q4VX76 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYTL3Q4VX76 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYTL3Q4VX76 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYTL3Q4VX76 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYTL3Q4VX76 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYTL3Q4VX76 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYTL3Q4VX76 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYTL3Q4VX76 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYTL3Q4VX76 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYTL3Q4VX76 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYTL3Q4VX76 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYTL3Q4VX76 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYTL3Q4VX76 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYTL3Q4VX76 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYTL3Q4VX76 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYTL3Q4VX76 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYTL3Q4VX76 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYTL3Q4VX76 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYTL3Q4VX76 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYTL3Q4VX76 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYTL3Q4VX76 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYTL3Q4VX76 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYTL3Q4VX76 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYTL3Q4VX76 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYTL3Q4VX76 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SYTL3Q4VX76 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYTL3Q4VX76 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYTL3Q4VX76 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYTL3Q4VX76 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYTL3Q4VX76 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYTL3Q4VX76 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SYTL3Q4VX76 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYTL3Q4VX76 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYTL3Q4VX76 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYTL3Q4VX76 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYTL3Q4VX76 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYTL3Q4VX76 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYTL3Q4VX76 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYTL3Q4VX76 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYTL3Q4VX76 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYTL3Q4VX76 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYTL3Q4VX76 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYTL3Q4VX76 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms