Protein–RNA interactions for Protein: Q3MJ16

PLA2G4E, Cytosolic phospholipase A2 epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G4EQ3MJ16 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLA2G4EQ3MJ16 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLA2G4EQ3MJ16 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLA2G4EQ3MJ16 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PLA2G4EQ3MJ16 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLA2G4EQ3MJ16 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLA2G4EQ3MJ16 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLA2G4EQ3MJ16 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLA2G4EQ3MJ16 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLA2G4EQ3MJ16 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLA2G4EQ3MJ16 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLA2G4EQ3MJ16 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PLA2G4EQ3MJ16 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLA2G4EQ3MJ16 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLA2G4EQ3MJ16 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PLA2G4EQ3MJ16 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLA2G4EQ3MJ16 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLA2G4EQ3MJ16 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLA2G4EQ3MJ16 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLA2G4EQ3MJ16 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLA2G4EQ3MJ16 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLA2G4EQ3MJ16 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLA2G4EQ3MJ16 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLA2G4EQ3MJ16 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLA2G4EQ3MJ16 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLA2G4EQ3MJ16 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLA2G4EQ3MJ16 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PLA2G4EQ3MJ16 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLA2G4EQ3MJ16 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLA2G4EQ3MJ16 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLA2G4EQ3MJ16 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PLA2G4EQ3MJ16 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PLA2G4EQ3MJ16 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PLA2G4EQ3MJ16 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PLA2G4EQ3MJ16 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PLA2G4EQ3MJ16 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PLA2G4EQ3MJ16 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PLA2G4EQ3MJ16 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLA2G4EQ3MJ16 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLA2G4EQ3MJ16 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLA2G4EQ3MJ16 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PLA2G4EQ3MJ16 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PLA2G4EQ3MJ16 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PLA2G4EQ3MJ16 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PLA2G4EQ3MJ16 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PLA2G4EQ3MJ16 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PLA2G4EQ3MJ16 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PLA2G4EQ3MJ16 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PLA2G4EQ3MJ16 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PLA2G4EQ3MJ16 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLA2G4EQ3MJ16 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLA2G4EQ3MJ16 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLA2G4EQ3MJ16 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLA2G4EQ3MJ16 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLA2G4EQ3MJ16 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLA2G4EQ3MJ16 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLA2G4EQ3MJ16 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLA2G4EQ3MJ16 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLA2G4EQ3MJ16 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PLA2G4EQ3MJ16 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLA2G4EQ3MJ16 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLA2G4EQ3MJ16 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLA2G4EQ3MJ16 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLA2G4EQ3MJ16 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLA2G4EQ3MJ16 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLA2G4EQ3MJ16 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLA2G4EQ3MJ16 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLA2G4EQ3MJ16 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLA2G4EQ3MJ16 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLA2G4EQ3MJ16 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLA2G4EQ3MJ16 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLA2G4EQ3MJ16 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLA2G4EQ3MJ16 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLA2G4EQ3MJ16 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLA2G4EQ3MJ16 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLA2G4EQ3MJ16 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLA2G4EQ3MJ16 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLA2G4EQ3MJ16 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLA2G4EQ3MJ16 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLA2G4EQ3MJ16 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLA2G4EQ3MJ16 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLA2G4EQ3MJ16 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLA2G4EQ3MJ16 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PLA2G4EQ3MJ16 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLA2G4EQ3MJ16 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLA2G4EQ3MJ16 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLA2G4EQ3MJ16 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLA2G4EQ3MJ16 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PLA2G4EQ3MJ16 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLA2G4EQ3MJ16 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLA2G4EQ3MJ16 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLA2G4EQ3MJ16 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLA2G4EQ3MJ16 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLA2G4EQ3MJ16 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLA2G4EQ3MJ16 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLA2G4EQ3MJ16 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLA2G4EQ3MJ16 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLA2G4EQ3MJ16 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLA2G4EQ3MJ16 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLA2G4EQ3MJ16 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms