Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF239Q16600 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF239Q16600 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF239Q16600 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF239Q16600 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF239Q16600 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF239Q16600 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF239Q16600 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF239Q16600 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF239Q16600 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF239Q16600 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF239Q16600 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF239Q16600 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF239Q16600 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF239Q16600 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF239Q16600 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF239Q16600 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF239Q16600 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF239Q16600 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF239Q16600 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF239Q16600 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF239Q16600 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF239Q16600 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF239Q16600 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF239Q16600 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF239Q16600 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF239Q16600 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF239Q16600 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF239Q16600 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF239Q16600 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF239Q16600 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF239Q16600 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF239Q16600 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF239Q16600 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF239Q16600 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF239Q16600 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF239Q16600 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF239Q16600 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF239Q16600 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF239Q16600 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF239Q16600 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF239Q16600 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF239Q16600 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF239Q16600 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF239Q16600 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF239Q16600 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF239Q16600 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF239Q16600 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF239Q16600 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF239Q16600 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF239Q16600 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF239Q16600 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF239Q16600 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF239Q16600 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF239Q16600 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF239Q16600 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF239Q16600 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF239Q16600 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF239Q16600 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF239Q16600 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF239Q16600 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF239Q16600 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF239Q16600 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF239Q16600 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF239Q16600 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF239Q16600 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF239Q16600 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF239Q16600 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF239Q16600 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF239Q16600 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF239Q16600 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF239Q16600 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF239Q16600 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF239Q16600 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF239Q16600 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF239Q16600 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF239Q16600 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF239Q16600 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF239Q16600 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF239Q16600 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF239Q16600 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF239Q16600 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF239Q16600 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF239Q16600 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF239Q16600 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF239Q16600 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF239Q16600 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF239Q16600 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF239Q16600 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF239Q16600 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF239Q16600 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF239Q16600 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF239Q16600 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF239Q16600 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF239Q16600 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF239Q16600 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF239Q16600 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF239Q16600 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF239Q16600 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF239Q16600 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
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