Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
VPS72Q15906 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
VPS72Q15906 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
VPS72Q15906 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
VPS72Q15906 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
VPS72Q15906 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
VPS72Q15906 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
VPS72Q15906 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
VPS72Q15906 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
VPS72Q15906 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
VPS72Q15906 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
VPS72Q15906 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
VPS72Q15906 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
VPS72Q15906 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
VPS72Q15906 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
VPS72Q15906 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
VPS72Q15906 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
VPS72Q15906 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
VPS72Q15906 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
VPS72Q15906 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
VPS72Q15906 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
VPS72Q15906 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
VPS72Q15906 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
VPS72Q15906 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
VPS72Q15906 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
VPS72Q15906 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
VPS72Q15906 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
VPS72Q15906 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
VPS72Q15906 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
VPS72Q15906 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
VPS72Q15906 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
VPS72Q15906 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
VPS72Q15906 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
VPS72Q15906 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
VPS72Q15906 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
VPS72Q15906 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
VPS72Q15906 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
VPS72Q15906 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
VPS72Q15906 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
VPS72Q15906 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
VPS72Q15906 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
VPS72Q15906 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
VPS72Q15906 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
VPS72Q15906 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
VPS72Q15906 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
VPS72Q15906 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
VPS72Q15906 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
VPS72Q15906 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
VPS72Q15906 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
VPS72Q15906 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
VPS72Q15906 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
VPS72Q15906 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
VPS72Q15906 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC35■■■■□ 3.19
VPS72Q15906 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
VPS72Q15906 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
VPS72Q15906 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
VPS72Q15906 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
VPS72Q15906 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
VPS72Q15906 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
VPS72Q15906 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
VPS72Q15906 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
VPS72Q15906 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
VPS72Q15906 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
VPS72Q15906 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
VPS72Q15906 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
VPS72Q15906 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
VPS72Q15906 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
VPS72Q15906 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
VPS72Q15906 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
VPS72Q15906 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
VPS72Q15906 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
VPS72Q15906 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
VPS72Q15906 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
VPS72Q15906 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
VPS72Q15906 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
VPS72Q15906 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
VPS72Q15906 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
VPS72Q15906 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
VPS72Q15906 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
VPS72Q15906 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
VPS72Q15906 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
VPS72Q15906 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
VPS72Q15906 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
VPS72Q15906 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
VPS72Q15906 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
VPS72Q15906 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
VPS72Q15906 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
VPS72Q15906 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
VPS72Q15906 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
VPS72Q15906 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
VPS72Q15906 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
VPS72Q15906 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
VPS72Q15906 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
VPS72Q15906 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
VPS72Q15906 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
VPS72Q15906 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
VPS72Q15906 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
VPS72Q15906 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
VPS72Q15906 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
VPS72Q15906 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms