Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NME3Q13232 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NME3Q13232 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NME3Q13232 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NME3Q13232 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NME3Q13232 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NME3Q13232 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NME3Q13232 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NME3Q13232 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NME3Q13232 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NME3Q13232 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NME3Q13232 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NME3Q13232 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NME3Q13232 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NME3Q13232 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NME3Q13232 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NME3Q13232 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NME3Q13232 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NME3Q13232 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NME3Q13232 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NME3Q13232 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NME3Q13232 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NME3Q13232 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NME3Q13232 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NME3Q13232 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NME3Q13232 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NME3Q13232 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NME3Q13232 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NME3Q13232 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NME3Q13232 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NME3Q13232 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NME3Q13232 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NME3Q13232 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NME3Q13232 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NME3Q13232 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NME3Q13232 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NME3Q13232 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NME3Q13232 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NME3Q13232 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NME3Q13232 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NME3Q13232 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NME3Q13232 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NME3Q13232 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NME3Q13232 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NME3Q13232 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NME3Q13232 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NME3Q13232 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NME3Q13232 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NME3Q13232 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NME3Q13232 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NME3Q13232 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NME3Q13232 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NME3Q13232 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NME3Q13232 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NME3Q13232 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NME3Q13232 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NME3Q13232 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NME3Q13232 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NME3Q13232 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NME3Q13232 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NME3Q13232 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NME3Q13232 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NME3Q13232 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NME3Q13232 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NME3Q13232 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NME3Q13232 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NME3Q13232 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NME3Q13232 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NME3Q13232 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NME3Q13232 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NME3Q13232 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NME3Q13232 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NME3Q13232 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NME3Q13232 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NME3Q13232 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NME3Q13232 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NME3Q13232 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NME3Q13232 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NME3Q13232 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NME3Q13232 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NME3Q13232 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NME3Q13232 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NME3Q13232 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NME3Q13232 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NME3Q13232 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NME3Q13232 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NME3Q13232 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NME3Q13232 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NME3Q13232 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NME3Q13232 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NME3Q13232 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NME3Q13232 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NME3Q13232 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NME3Q13232 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NME3Q13232 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NME3Q13232 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NME3Q13232 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NME3Q13232 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NME3Q13232 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NME3Q13232 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
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