Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NME3Q13232 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NME3Q13232 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NME3Q13232 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NME3Q13232 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NME3Q13232 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NME3Q13232 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NME3Q13232 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NME3Q13232 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NME3Q13232 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NME3Q13232 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NME3Q13232 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NME3Q13232 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NME3Q13232 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NME3Q13232 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NME3Q13232 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NME3Q13232 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NME3Q13232 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NME3Q13232 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NME3Q13232 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NME3Q13232 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NME3Q13232 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NME3Q13232 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NME3Q13232 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NME3Q13232 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NME3Q13232 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NME3Q13232 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NME3Q13232 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NME3Q13232 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NME3Q13232 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NME3Q13232 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NME3Q13232 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NME3Q13232 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NME3Q13232 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NME3Q13232 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NME3Q13232 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NME3Q13232 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NME3Q13232 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NME3Q13232 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NME3Q13232 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NME3Q13232 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NME3Q13232 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NME3Q13232 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NME3Q13232 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NME3Q13232 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NME3Q13232 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NME3Q13232 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NME3Q13232 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NME3Q13232 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NME3Q13232 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NME3Q13232 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NME3Q13232 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NME3Q13232 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NME3Q13232 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NME3Q13232 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NME3Q13232 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NME3Q13232 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NME3Q13232 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NME3Q13232 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NME3Q13232 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NME3Q13232 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NME3Q13232 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NME3Q13232 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NME3Q13232 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NME3Q13232 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NME3Q13232 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NME3Q13232 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NME3Q13232 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NME3Q13232 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NME3Q13232 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NME3Q13232 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NME3Q13232 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NME3Q13232 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NME3Q13232 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NME3Q13232 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NME3Q13232 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NME3Q13232 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NME3Q13232 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NME3Q13232 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NME3Q13232 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NME3Q13232 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NME3Q13232 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NME3Q13232 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NME3Q13232 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NME3Q13232 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NME3Q13232 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NME3Q13232 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NME3Q13232 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NME3Q13232 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NME3Q13232 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NME3Q13232 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NME3Q13232 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NME3Q13232 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NME3Q13232 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NME3Q13232 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NME3Q13232 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NME3Q13232 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NME3Q13232 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NME3Q13232 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NME3Q13232 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms