Protein–RNA interactions for Protein: Q06413

MEF2C, Myocyte-specific enhancer factor 2C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEF2CQ06413 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MEF2CQ06413 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MEF2CQ06413 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MEF2CQ06413 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
MEF2CQ06413 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MEF2CQ06413 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MEF2CQ06413 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MEF2CQ06413 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MEF2CQ06413 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MEF2CQ06413 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MEF2CQ06413 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MEF2CQ06413 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MEF2CQ06413 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEF2CQ06413 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEF2CQ06413 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEF2CQ06413 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEF2CQ06413 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEF2CQ06413 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEF2CQ06413 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEF2CQ06413 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEF2CQ06413 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEF2CQ06413 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MEF2CQ06413 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEF2CQ06413 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEF2CQ06413 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEF2CQ06413 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEF2CQ06413 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEF2CQ06413 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEF2CQ06413 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEF2CQ06413 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEF2CQ06413 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEF2CQ06413 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEF2CQ06413 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEF2CQ06413 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEF2CQ06413 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEF2CQ06413 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEF2CQ06413 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEF2CQ06413 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEF2CQ06413 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEF2CQ06413 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEF2CQ06413 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEF2CQ06413 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEF2CQ06413 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEF2CQ06413 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MEF2CQ06413 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MEF2CQ06413 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MEF2CQ06413 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MEF2CQ06413 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MEF2CQ06413 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MEF2CQ06413 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MEF2CQ06413 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MEF2CQ06413 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MEF2CQ06413 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MEF2CQ06413 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MEF2CQ06413 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MEF2CQ06413 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MEF2CQ06413 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MEF2CQ06413 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MEF2CQ06413 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MEF2CQ06413 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MEF2CQ06413 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MEF2CQ06413 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
MEF2CQ06413 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MEF2CQ06413 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MEF2CQ06413 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MEF2CQ06413 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MEF2CQ06413 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MEF2CQ06413 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MEF2CQ06413 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MEF2CQ06413 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MEF2CQ06413 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MEF2CQ06413 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MEF2CQ06413 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MEF2CQ06413 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MEF2CQ06413 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MEF2CQ06413 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MEF2CQ06413 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MEF2CQ06413 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MEF2CQ06413 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MEF2CQ06413 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MEF2CQ06413 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MEF2CQ06413 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MEF2CQ06413 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MEF2CQ06413 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MEF2CQ06413 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MEF2CQ06413 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MEF2CQ06413 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MEF2CQ06413 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MEF2CQ06413 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MEF2CQ06413 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MEF2CQ06413 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MEF2CQ06413 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MEF2CQ06413 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MEF2CQ06413 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MEF2CQ06413 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MEF2CQ06413 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MEF2CQ06413 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MEF2CQ06413 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MEF2CQ06413 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MEF2CQ06413 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.2 ms