Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RELAQ04206 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RELAQ04206 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RELAQ04206 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RELAQ04206 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RELAQ04206 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RELAQ04206 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RELAQ04206 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RELAQ04206 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RELAQ04206 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RELAQ04206 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RELAQ04206 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RELAQ04206 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RELAQ04206 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RELAQ04206 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RELAQ04206 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RELAQ04206 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RELAQ04206 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RELAQ04206 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RELAQ04206 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RELAQ04206 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RELAQ04206 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RELAQ04206 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RELAQ04206 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RELAQ04206 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RELAQ04206 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RELAQ04206 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RELAQ04206 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RELAQ04206 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RELAQ04206 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RELAQ04206 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RELAQ04206 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RELAQ04206 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RELAQ04206 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RELAQ04206 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RELAQ04206 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RELAQ04206 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RELAQ04206 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RELAQ04206 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RELAQ04206 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RELAQ04206 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RELAQ04206 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RELAQ04206 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RELAQ04206 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RELAQ04206 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RELAQ04206 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RELAQ04206 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
RELAQ04206 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RELAQ04206 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RELAQ04206 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RELAQ04206 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RELAQ04206 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RELAQ04206 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RELAQ04206 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RELAQ04206 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RELAQ04206 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RELAQ04206 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RELAQ04206 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RELAQ04206 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RELAQ04206 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RELAQ04206 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RELAQ04206 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RELAQ04206 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RELAQ04206 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RELAQ04206 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RELAQ04206 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RELAQ04206 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RELAQ04206 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RELAQ04206 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RELAQ04206 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RELAQ04206 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RELAQ04206 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RELAQ04206 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RELAQ04206 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RELAQ04206 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RELAQ04206 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RELAQ04206 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RELAQ04206 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RELAQ04206 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RELAQ04206 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RELAQ04206 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RELAQ04206 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RELAQ04206 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RELAQ04206 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RELAQ04206 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RELAQ04206 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RELAQ04206 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RELAQ04206 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RELAQ04206 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RELAQ04206 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RELAQ04206 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RELAQ04206 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RELAQ04206 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RELAQ04206 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RELAQ04206 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RELAQ04206 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RELAQ04206 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RELAQ04206 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RELAQ04206 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RELAQ04206 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms