Protein–RNA interactions for Protein: P62899

RPL31, 60S ribosomal protein L31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL31P62899 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL31P62899 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL31P62899 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL31P62899 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL31P62899 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL31P62899 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL31P62899 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL31P62899 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL31P62899 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL31P62899 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL31P62899 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL31P62899 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL31P62899 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL31P62899 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL31P62899 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL31P62899 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL31P62899 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL31P62899 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL31P62899 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL31P62899 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL31P62899 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL31P62899 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL31P62899 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL31P62899 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL31P62899 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL31P62899 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL31P62899 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL31P62899 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL31P62899 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL31P62899 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL31P62899 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL31P62899 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL31P62899 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL31P62899 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL31P62899 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL31P62899 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL31P62899 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL31P62899 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL31P62899 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL31P62899 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL31P62899 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL31P62899 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL31P62899 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL31P62899 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL31P62899 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL31P62899 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL31P62899 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL31P62899 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL31P62899 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL31P62899 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL31P62899 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL31P62899 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL31P62899 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL31P62899 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL31P62899 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL31P62899 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL31P62899 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL31P62899 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL31P62899 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL31P62899 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL31P62899 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL31P62899 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL31P62899 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL31P62899 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL31P62899 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL31P62899 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL31P62899 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL31P62899 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL31P62899 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL31P62899 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL31P62899 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL31P62899 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL31P62899 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL31P62899 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL31P62899 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL31P62899 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL31P62899 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL31P62899 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL31P62899 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL31P62899 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL31P62899 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL31P62899 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL31P62899 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL31P62899 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL31P62899 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL31P62899 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL31P62899 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL31P62899 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL31P62899 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL31P62899 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL31P62899 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL31P62899 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL31P62899 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL31P62899 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL31P62899 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL31P62899 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL31P62899 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL31P62899 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL31P62899 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL31P62899 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms