Protein–RNA interactions for Protein: P59797

SELENOV, Selenoprotein V, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOVP59797 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SELENOVP59797 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SELENOVP59797 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SELENOVP59797 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SELENOVP59797 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SELENOVP59797 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SELENOVP59797 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SELENOVP59797 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SELENOVP59797 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SELENOVP59797 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SELENOVP59797 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELENOVP59797 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELENOVP59797 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELENOVP59797 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELENOVP59797 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELENOVP59797 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SELENOVP59797 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SELENOVP59797 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SELENOVP59797 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SELENOVP59797 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SELENOVP59797 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SELENOVP59797 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SELENOVP59797 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SELENOVP59797 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SELENOVP59797 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SELENOVP59797 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SELENOVP59797 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SELENOVP59797 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SELENOVP59797 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SELENOVP59797 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SELENOVP59797 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SELENOVP59797 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SELENOVP59797 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SELENOVP59797 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SELENOVP59797 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SELENOVP59797 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SELENOVP59797 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SELENOVP59797 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SELENOVP59797 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SELENOVP59797 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SELENOVP59797 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SELENOVP59797 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SELENOVP59797 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SELENOVP59797 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SELENOVP59797 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SELENOVP59797 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SELENOVP59797 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SELENOVP59797 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SELENOVP59797 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SELENOVP59797 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SELENOVP59797 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SELENOVP59797 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SELENOVP59797 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SELENOVP59797 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SELENOVP59797 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SELENOVP59797 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SELENOVP59797 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SELENOVP59797 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SELENOVP59797 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SELENOVP59797 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SELENOVP59797 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SELENOVP59797 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SELENOVP59797 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SELENOVP59797 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SELENOVP59797 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SELENOVP59797 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELENOVP59797 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELENOVP59797 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELENOVP59797 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELENOVP59797 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELENOVP59797 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELENOVP59797 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELENOVP59797 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SELENOVP59797 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SELENOVP59797 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SELENOVP59797 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELENOVP59797 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELENOVP59797 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELENOVP59797 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELENOVP59797 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELENOVP59797 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELENOVP59797 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELENOVP59797 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELENOVP59797 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELENOVP59797 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SELENOVP59797 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SELENOVP59797 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SELENOVP59797 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SELENOVP59797 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SELENOVP59797 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SELENOVP59797 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SELENOVP59797 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SELENOVP59797 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SELENOVP59797 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SELENOVP59797 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SELENOVP59797 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SELENOVP59797 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SELENOVP59797 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SELENOVP59797 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SELENOVP59797 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms