Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
BRPF1P55201 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
BRPF1P55201 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
BRPF1P55201 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
BRPF1P55201 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
BRPF1P55201 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
BRPF1P55201 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
BRPF1P55201 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
BRPF1P55201 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
BRPF1P55201 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
BRPF1P55201 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
BRPF1P55201 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
BRPF1P55201 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
BRPF1P55201 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
BRPF1P55201 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
BRPF1P55201 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
BRPF1P55201 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
BRPF1P55201 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
BRPF1P55201 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
BRPF1P55201 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
BRPF1P55201 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
BRPF1P55201 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
BRPF1P55201 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
BRPF1P55201 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
BRPF1P55201 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
BRPF1P55201 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
BRPF1P55201 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
BRPF1P55201 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
BRPF1P55201 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
BRPF1P55201 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
BRPF1P55201 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
BRPF1P55201 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
BRPF1P55201 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
BRPF1P55201 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
BRPF1P55201 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
BRPF1P55201 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
BRPF1P55201 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
BRPF1P55201 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
BRPF1P55201 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.18■■■□□ 2.9
BRPF1P55201 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
BRPF1P55201 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
BRPF1P55201 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
BRPF1P55201 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
BRPF1P55201 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
BRPF1P55201 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
BRPF1P55201 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
BRPF1P55201 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
BRPF1P55201 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
BRPF1P55201 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
BRPF1P55201 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
BRPF1P55201 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
BRPF1P55201 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
BRPF1P55201 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
BRPF1P55201 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
BRPF1P55201 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
BRPF1P55201 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
BRPF1P55201 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
BRPF1P55201 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
BRPF1P55201 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
BRPF1P55201 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
BRPF1P55201 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
BRPF1P55201 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
BRPF1P55201 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
BRPF1P55201 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
BRPF1P55201 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
BRPF1P55201 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
BRPF1P55201 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
BRPF1P55201 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
BRPF1P55201 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
BRPF1P55201 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
BRPF1P55201 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
BRPF1P55201 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
BRPF1P55201 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
BRPF1P55201 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
BRPF1P55201 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
BRPF1P55201 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
BRPF1P55201 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
BRPF1P55201 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
BRPF1P55201 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.06■■■□□ 2.88
BRPF1P55201 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
BRPF1P55201 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
BRPF1P55201 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
BRPF1P55201 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
BRPF1P55201 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
BRPF1P55201 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
BRPF1P55201 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
BRPF1P55201 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
BRPF1P55201 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
BRPF1P55201 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
BRPF1P55201 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
BRPF1P55201 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
BRPF1P55201 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
BRPF1P55201 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
BRPF1P55201 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
BRPF1P55201 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
BRPF1P55201 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
BRPF1P55201 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
BRPF1P55201 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
BRPF1P55201 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
BRPF1P55201 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms