Protein–RNA interactions for Protein: P49753

ACOT2, Acyl-coenzyme A thioesterase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOT2P49753 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ACOT2P49753 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ACOT2P49753 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ACOT2P49753 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ACOT2P49753 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ACOT2P49753 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACOT2P49753 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACOT2P49753 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACOT2P49753 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACOT2P49753 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ACOT2P49753 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ACOT2P49753 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACOT2P49753 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACOT2P49753 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACOT2P49753 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACOT2P49753 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACOT2P49753 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACOT2P49753 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACOT2P49753 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ACOT2P49753 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACOT2P49753 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACOT2P49753 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACOT2P49753 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACOT2P49753 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACOT2P49753 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACOT2P49753 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACOT2P49753 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACOT2P49753 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACOT2P49753 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACOT2P49753 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACOT2P49753 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACOT2P49753 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ACOT2P49753 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ACOT2P49753 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ACOT2P49753 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ACOT2P49753 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ACOT2P49753 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ACOT2P49753 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ACOT2P49753 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ACOT2P49753 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ACOT2P49753 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ACOT2P49753 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ACOT2P49753 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ACOT2P49753 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ACOT2P49753 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ACOT2P49753 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACOT2P49753 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACOT2P49753 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACOT2P49753 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACOT2P49753 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ACOT2P49753 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ACOT2P49753 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ACOT2P49753 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACOT2P49753 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACOT2P49753 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACOT2P49753 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACOT2P49753 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ACOT2P49753 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ACOT2P49753 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACOT2P49753 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACOT2P49753 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ACOT2P49753 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACOT2P49753 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ACOT2P49753 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ACOT2P49753 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ACOT2P49753 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ACOT2P49753 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ACOT2P49753 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ACOT2P49753 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ACOT2P49753 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ACOT2P49753 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ACOT2P49753 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ACOT2P49753 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ACOT2P49753 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ACOT2P49753 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ACOT2P49753 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ACOT2P49753 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ACOT2P49753 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ACOT2P49753 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ACOT2P49753 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ACOT2P49753 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ACOT2P49753 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ACOT2P49753 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ACOT2P49753 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ACOT2P49753 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ACOT2P49753 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ACOT2P49753 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ACOT2P49753 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ACOT2P49753 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ACOT2P49753 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ACOT2P49753 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ACOT2P49753 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ACOT2P49753 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ACOT2P49753 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ACOT2P49753 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ACOT2P49753 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ACOT2P49753 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ACOT2P49753 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ACOT2P49753 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ACOT2P49753 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms