Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI3P19429 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI3P19429 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI3P19429 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI3P19429 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI3P19429 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNNI3P19429 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI3P19429 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI3P19429 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI3P19429 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI3P19429 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI3P19429 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNI3P19429 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI3P19429 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI3P19429 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI3P19429 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI3P19429 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNI3P19429 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNI3P19429 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNI3P19429 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI3P19429 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI3P19429 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI3P19429 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI3P19429 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI3P19429 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNI3P19429 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNI3P19429 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNI3P19429 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNI3P19429 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNI3P19429 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI3P19429 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI3P19429 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNI3P19429 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNI3P19429 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI3P19429 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI3P19429 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI3P19429 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI3P19429 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNI3P19429 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNI3P19429 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNI3P19429 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI3P19429 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI3P19429 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNI3P19429 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI3P19429 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI3P19429 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI3P19429 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI3P19429 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNI3P19429 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI3P19429 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI3P19429 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI3P19429 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNI3P19429 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI3P19429 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI3P19429 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI3P19429 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI3P19429 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNI3P19429 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI3P19429 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI3P19429 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNI3P19429 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNI3P19429 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNI3P19429 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNI3P19429 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNNI3P19429 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI3P19429 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI3P19429 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI3P19429 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI3P19429 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI3P19429 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNI3P19429 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI3P19429 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNI3P19429 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI3P19429 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI3P19429 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNI3P19429 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI3P19429 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNI3P19429 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI3P19429 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI3P19429 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI3P19429 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI3P19429 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI3P19429 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI3P19429 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI3P19429 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI3P19429 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNI3P19429 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI3P19429 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI3P19429 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNI3P19429 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNI3P19429 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI3P19429 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI3P19429 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNI3P19429 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI3P19429 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI3P19429 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI3P19429 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI3P19429 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI3P19429 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI3P19429 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms