Protein–RNA interactions for Protein: P17039

ZNF30, Zinc finger protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF30P17039 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF30P17039 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF30P17039 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF30P17039 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF30P17039 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF30P17039 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF30P17039 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF30P17039 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZNF30P17039 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF30P17039 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF30P17039 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF30P17039 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF30P17039 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF30P17039 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF30P17039 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF30P17039 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF30P17039 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF30P17039 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF30P17039 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF30P17039 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF30P17039 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF30P17039 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF30P17039 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF30P17039 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF30P17039 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF30P17039 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF30P17039 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF30P17039 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF30P17039 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF30P17039 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF30P17039 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF30P17039 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF30P17039 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF30P17039 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF30P17039 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF30P17039 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF30P17039 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF30P17039 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF30P17039 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF30P17039 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF30P17039 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF30P17039 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF30P17039 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF30P17039 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF30P17039 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF30P17039 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF30P17039 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF30P17039 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF30P17039 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF30P17039 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF30P17039 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF30P17039 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZNF30P17039 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF30P17039 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF30P17039 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF30P17039 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF30P17039 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF30P17039 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF30P17039 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF30P17039 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF30P17039 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF30P17039 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF30P17039 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF30P17039 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF30P17039 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF30P17039 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF30P17039 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF30P17039 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF30P17039 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF30P17039 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF30P17039 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF30P17039 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF30P17039 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF30P17039 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF30P17039 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF30P17039 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF30P17039 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF30P17039 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF30P17039 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF30P17039 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF30P17039 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF30P17039 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF30P17039 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF30P17039 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF30P17039 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF30P17039 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF30P17039 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF30P17039 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF30P17039 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF30P17039 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF30P17039 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF30P17039 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF30P17039 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF30P17039 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF30P17039 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF30P17039 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF30P17039 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF30P17039 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF30P17039 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF30P17039 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms