Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRF1P14222 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRF1P14222 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRF1P14222 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRF1P14222 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRF1P14222 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRF1P14222 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRF1P14222 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRF1P14222 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRF1P14222 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRF1P14222 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRF1P14222 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRF1P14222 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRF1P14222 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRF1P14222 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRF1P14222 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRF1P14222 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRF1P14222 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRF1P14222 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRF1P14222 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRF1P14222 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRF1P14222 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRF1P14222 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRF1P14222 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRF1P14222 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRF1P14222 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRF1P14222 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRF1P14222 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRF1P14222 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRF1P14222 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRF1P14222 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRF1P14222 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRF1P14222 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRF1P14222 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRF1P14222 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRF1P14222 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRF1P14222 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRF1P14222 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRF1P14222 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRF1P14222 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRF1P14222 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRF1P14222 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRF1P14222 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRF1P14222 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRF1P14222 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRF1P14222 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRF1P14222 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRF1P14222 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRF1P14222 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRF1P14222 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRF1P14222 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRF1P14222 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRF1P14222 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRF1P14222 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRF1P14222 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRF1P14222 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRF1P14222 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRF1P14222 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRF1P14222 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRF1P14222 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRF1P14222 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRF1P14222 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRF1P14222 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRF1P14222 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRF1P14222 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRF1P14222 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRF1P14222 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRF1P14222 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRF1P14222 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRF1P14222 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRF1P14222 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRF1P14222 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PRF1P14222 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRF1P14222 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRF1P14222 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRF1P14222 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRF1P14222 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRF1P14222 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRF1P14222 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRF1P14222 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRF1P14222 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRF1P14222 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRF1P14222 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRF1P14222 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRF1P14222 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRF1P14222 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRF1P14222 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRF1P14222 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRF1P14222 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRF1P14222 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRF1P14222 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRF1P14222 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRF1P14222 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRF1P14222 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRF1P14222 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRF1P14222 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRF1P14222 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRF1P14222 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRF1P14222 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRF1P14222 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms