Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCL5P13501 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCL5P13501 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCL5P13501 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCL5P13501 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCL5P13501 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCL5P13501 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCL5P13501 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCL5P13501 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCL5P13501 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCL5P13501 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCL5P13501 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCL5P13501 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCL5P13501 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCL5P13501 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCL5P13501 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCL5P13501 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCL5P13501 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCL5P13501 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCL5P13501 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCL5P13501 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCL5P13501 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCL5P13501 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCL5P13501 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCL5P13501 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCL5P13501 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CCL5P13501 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCL5P13501 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCL5P13501 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCL5P13501 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CCL5P13501 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCL5P13501 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCL5P13501 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCL5P13501 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCL5P13501 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCL5P13501 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCL5P13501 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCL5P13501 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCL5P13501 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCL5P13501 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCL5P13501 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCL5P13501 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCL5P13501 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCL5P13501 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCL5P13501 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCL5P13501 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCL5P13501 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCL5P13501 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCL5P13501 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCL5P13501 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCL5P13501 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCL5P13501 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CCL5P13501 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCL5P13501 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCL5P13501 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCL5P13501 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CCL5P13501 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCL5P13501 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCL5P13501 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCL5P13501 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCL5P13501 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CCL5P13501 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCL5P13501 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCL5P13501 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCL5P13501 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCL5P13501 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCL5P13501 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CCL5P13501 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCL5P13501 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CCL5P13501 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCL5P13501 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCL5P13501 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCL5P13501 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCL5P13501 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCL5P13501 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCL5P13501 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCL5P13501 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCL5P13501 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CCL5P13501 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCL5P13501 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCL5P13501 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCL5P13501 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCL5P13501 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCL5P13501 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCL5P13501 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCL5P13501 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCL5P13501 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCL5P13501 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCL5P13501 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCL5P13501 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCL5P13501 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCL5P13501 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCL5P13501 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCL5P13501 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCL5P13501 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCL5P13501 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCL5P13501 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCL5P13501 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCL5P13501 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCL5P13501 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms