Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTHFD1P11586 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MTHFD1P11586 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTHFD1P11586 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTHFD1P11586 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTHFD1P11586 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MTHFD1P11586 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTHFD1P11586 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTHFD1P11586 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTHFD1P11586 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTHFD1P11586 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTHFD1P11586 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTHFD1P11586 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTHFD1P11586 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTHFD1P11586 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTHFD1P11586 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTHFD1P11586 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTHFD1P11586 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTHFD1P11586 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTHFD1P11586 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTHFD1P11586 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTHFD1P11586 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTHFD1P11586 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTHFD1P11586 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTHFD1P11586 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTHFD1P11586 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTHFD1P11586 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTHFD1P11586 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTHFD1P11586 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTHFD1P11586 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTHFD1P11586 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MTHFD1P11586 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTHFD1P11586 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTHFD1P11586 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTHFD1P11586 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTHFD1P11586 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTHFD1P11586 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MTHFD1P11586 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MTHFD1P11586 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MTHFD1P11586 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MTHFD1P11586 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTHFD1P11586 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTHFD1P11586 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTHFD1P11586 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTHFD1P11586 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTHFD1P11586 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTHFD1P11586 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTHFD1P11586 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTHFD1P11586 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTHFD1P11586 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTHFD1P11586 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTHFD1P11586 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MTHFD1P11586 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTHFD1P11586 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MTHFD1P11586 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTHFD1P11586 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTHFD1P11586 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTHFD1P11586 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTHFD1P11586 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTHFD1P11586 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTHFD1P11586 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTHFD1P11586 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTHFD1P11586 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTHFD1P11586 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTHFD1P11586 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTHFD1P11586 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTHFD1P11586 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTHFD1P11586 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MTHFD1P11586 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTHFD1P11586 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTHFD1P11586 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTHFD1P11586 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTHFD1P11586 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTHFD1P11586 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTHFD1P11586 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTHFD1P11586 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MTHFD1P11586 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTHFD1P11586 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTHFD1P11586 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTHFD1P11586 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTHFD1P11586 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTHFD1P11586 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTHFD1P11586 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTHFD1P11586 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTHFD1P11586 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTHFD1P11586 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTHFD1P11586 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTHFD1P11586 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTHFD1P11586 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTHFD1P11586 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTHFD1P11586 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTHFD1P11586 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTHFD1P11586 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MTHFD1P11586 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTHFD1P11586 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MTHFD1P11586 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTHFD1P11586 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTHFD1P11586 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTHFD1P11586 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTHFD1P11586 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms