Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SLIT2O94813 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SLIT2O94813 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SLIT2O94813 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
SLIT2O94813 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SLIT2O94813 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SLIT2O94813 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SLIT2O94813 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SLIT2O94813 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SLIT2O94813 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SLIT2O94813 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SLIT2O94813 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SLIT2O94813 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
SLIT2O94813 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SLIT2O94813 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SLIT2O94813 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SLIT2O94813 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SLIT2O94813 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SLIT2O94813 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
SLIT2O94813 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SLIT2O94813 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
SLIT2O94813 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SLIT2O94813 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SLIT2O94813 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SLIT2O94813 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SLIT2O94813 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SLIT2O94813 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SLIT2O94813 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
SLIT2O94813 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.25
SLIT2O94813 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SLIT2O94813 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SLIT2O94813 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SLIT2O94813 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SLIT2O94813 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SLIT2O94813 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SLIT2O94813 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SLIT2O94813 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SLIT2O94813 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SLIT2O94813 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SLIT2O94813 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SLIT2O94813 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SLIT2O94813 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.23
SLIT2O94813 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SLIT2O94813 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SLIT2O94813 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
SLIT2O94813 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SLIT2O94813 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SLIT2O94813 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SLIT2O94813 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
SLIT2O94813 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SLIT2O94813 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SLIT2O94813 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SLIT2O94813 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SLIT2O94813 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
SLIT2O94813 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SLIT2O94813 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
SLIT2O94813 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SLIT2O94813 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SLIT2O94813 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SLIT2O94813 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
SLIT2O94813 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SLIT2O94813 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SLIT2O94813 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SLIT2O94813 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SLIT2O94813 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
SLIT2O94813 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SLIT2O94813 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SLIT2O94813 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SLIT2O94813 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SLIT2O94813 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SLIT2O94813 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SLIT2O94813 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
SLIT2O94813 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SLIT2O94813 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SLIT2O94813 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SLIT2O94813 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SLIT2O94813 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SLIT2O94813 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SLIT2O94813 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SLIT2O94813 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
SLIT2O94813 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
SLIT2O94813 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SLIT2O94813 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SLIT2O94813 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SLIT2O94813 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SLIT2O94813 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SLIT2O94813 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SLIT2O94813 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SLIT2O94813 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SLIT2O94813 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SLIT2O94813 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
SLIT2O94813 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.19
SLIT2O94813 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
SLIT2O94813 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
SLIT2O94813 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
SLIT2O94813 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SLIT2O94813 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SLIT2O94813 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
SLIT2O94813 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
SLIT2O94813 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms