Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC47.15■■■■■ 5.14
SLIT2O94813 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC46.87■■■■■ 5.09
SLIT2O94813 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.6■■■■■ 5.05
SLIT2O94813 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
SLIT2O94813 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
SLIT2O94813 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
SLIT2O94813 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.01■■■■■ 4.8
SLIT2O94813 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC44.9■■■■■ 4.78
SLIT2O94813 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
SLIT2O94813 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.77■■■■■ 4.76
SLIT2O94813 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
SLIT2O94813 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC44.54■■■■■ 4.72
SLIT2O94813 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC44.45■■■■■ 4.71
SLIT2O94813 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
SLIT2O94813 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
SLIT2O94813 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC44.23■■■■■ 4.67
SLIT2O94813 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.99■■■■■ 4.63
SLIT2O94813 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
SLIT2O94813 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
SLIT2O94813 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.63■■■■■ 4.58
SLIT2O94813 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.56
SLIT2O94813 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.56
SLIT2O94813 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC43.48■■■■■ 4.55
SLIT2O94813 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.39■■■■■ 4.54
SLIT2O94813 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
SLIT2O94813 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
SLIT2O94813 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC43.22■■■■■ 4.51
SLIT2O94813 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC43.22■■■■■ 4.51
SLIT2O94813 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC43.14■■■■■ 4.5
SLIT2O94813 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC42.99■■■■■ 4.47
SLIT2O94813 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.94■■■■■ 4.46
SLIT2O94813 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
SLIT2O94813 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
SLIT2O94813 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
SLIT2O94813 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
SLIT2O94813 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
SLIT2O94813 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
SLIT2O94813 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
SLIT2O94813 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
SLIT2O94813 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
SLIT2O94813 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
SLIT2O94813 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
SLIT2O94813 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
SLIT2O94813 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
SLIT2O94813 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
SLIT2O94813 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
SLIT2O94813 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
SLIT2O94813 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
SLIT2O94813 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
SLIT2O94813 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
SLIT2O94813 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC41.54■■■■■ 4.24
SLIT2O94813 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC41.51■■■■■ 4.24
SLIT2O94813 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
SLIT2O94813 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
SLIT2O94813 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC41.46■■■■■ 4.23
SLIT2O94813 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
SLIT2O94813 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
SLIT2O94813 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.39■■■■■ 4.22
SLIT2O94813 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
SLIT2O94813 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
SLIT2O94813 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC41.16■■■■■ 4.18
SLIT2O94813 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
SLIT2O94813 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
SLIT2O94813 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
SLIT2O94813 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
SLIT2O94813 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
SLIT2O94813 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
SLIT2O94813 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
SLIT2O94813 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
SLIT2O94813 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
SLIT2O94813 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
SLIT2O94813 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
SLIT2O94813 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.12
SLIT2O94813 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
SLIT2O94813 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC40.79■■■■■ 4.12
SLIT2O94813 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
SLIT2O94813 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
SLIT2O94813 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
SLIT2O94813 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC40.67■■■■■ 4.1
SLIT2O94813 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
SLIT2O94813 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
SLIT2O94813 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
SLIT2O94813 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
SLIT2O94813 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
SLIT2O94813 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
SLIT2O94813 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
SLIT2O94813 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC40.49■■■■■ 4.07
SLIT2O94813 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
SLIT2O94813 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
SLIT2O94813 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC40.46■■■■■ 4.07
SLIT2O94813 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
SLIT2O94813 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
SLIT2O94813 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
SLIT2O94813 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
SLIT2O94813 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
SLIT2O94813 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
SLIT2O94813 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
SLIT2O94813 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
SLIT2O94813 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC40.4■■■■■ 4.06
SLIT2O94813 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms