Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB3O75712 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJB3O75712 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJB3O75712 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJB3O75712 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJB3O75712 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJB3O75712 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJB3O75712 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJB3O75712 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
GJB3O75712 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJB3O75712 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJB3O75712 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJB3O75712 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJB3O75712 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJB3O75712 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJB3O75712 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJB3O75712 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJB3O75712 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJB3O75712 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJB3O75712 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GJB3O75712 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJB3O75712 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJB3O75712 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJB3O75712 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJB3O75712 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GJB3O75712 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GJB3O75712 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJB3O75712 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJB3O75712 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB3O75712 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB3O75712 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB3O75712 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB3O75712 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB3O75712 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GJB3O75712 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB3O75712 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB3O75712 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB3O75712 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB3O75712 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB3O75712 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB3O75712 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB3O75712 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB3O75712 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB3O75712 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB3O75712 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB3O75712 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GJB3O75712 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB3O75712 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB3O75712 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB3O75712 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJB3O75712 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJB3O75712 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJB3O75712 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJB3O75712 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJB3O75712 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJB3O75712 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJB3O75712 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJB3O75712 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJB3O75712 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJB3O75712 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GJB3O75712 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJB3O75712 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJB3O75712 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJB3O75712 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB3O75712 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB3O75712 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB3O75712 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB3O75712 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB3O75712 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB3O75712 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJB3O75712 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJB3O75712 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJB3O75712 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJB3O75712 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJB3O75712 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GJB3O75712 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GJB3O75712 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJB3O75712 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJB3O75712 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJB3O75712 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJB3O75712 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJB3O75712 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GJB3O75712 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJB3O75712 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJB3O75712 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJB3O75712 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJB3O75712 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJB3O75712 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJB3O75712 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJB3O75712 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJB3O75712 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJB3O75712 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJB3O75712 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJB3O75712 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJB3O75712 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJB3O75712 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJB3O75712 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJB3O75712 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJB3O75712 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GJB3O75712 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms