Protein–RNA interactions for Protein: O75592

MYCBP2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, humanhuman

Predictions only

Length 4,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBP2O75592 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MYCBP2O75592 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MYCBP2O75592 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYCBP2O75592 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBP2O75592 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms