Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGTAO43765 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGTAO43765 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SGTAO43765 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SGTAO43765 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SGTAO43765 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SGTAO43765 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SGTAO43765 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGTAO43765 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGTAO43765 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGTAO43765 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGTAO43765 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SGTAO43765 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SGTAO43765 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SGTAO43765 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SGTAO43765 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SGTAO43765 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGTAO43765 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGTAO43765 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGTAO43765 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGTAO43765 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGTAO43765 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGTAO43765 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGTAO43765 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGTAO43765 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SGTAO43765 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SGTAO43765 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SGTAO43765 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SGTAO43765 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SGTAO43765 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SGTAO43765 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SGTAO43765 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SGTAO43765 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGTAO43765 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGTAO43765 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGTAO43765 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGTAO43765 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SGTAO43765 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SGTAO43765 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGTAO43765 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGTAO43765 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGTAO43765 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGTAO43765 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGTAO43765 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGTAO43765 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGTAO43765 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGTAO43765 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGTAO43765 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGTAO43765 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGTAO43765 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGTAO43765 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGTAO43765 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SGTAO43765 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SGTAO43765 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SGTAO43765 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
SGTAO43765 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGTAO43765 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGTAO43765 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGTAO43765 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGTAO43765 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGTAO43765 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SGTAO43765 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGTAO43765 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGTAO43765 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGTAO43765 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGTAO43765 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGTAO43765 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGTAO43765 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGTAO43765 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SGTAO43765 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGTAO43765 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGTAO43765 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SGTAO43765 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGTAO43765 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGTAO43765 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGTAO43765 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGTAO43765 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGTAO43765 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGTAO43765 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGTAO43765 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGTAO43765 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGTAO43765 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGTAO43765 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGTAO43765 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGTAO43765 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SGTAO43765 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SGTAO43765 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SGTAO43765 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGTAO43765 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGTAO43765 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGTAO43765 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGTAO43765 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGTAO43765 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGTAO43765 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGTAO43765 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGTAO43765 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGTAO43765 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGTAO43765 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SGTAO43765 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SGTAO43765 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms