Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATCO43716 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATCO43716 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATCO43716 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATCO43716 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATCO43716 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATCO43716 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATCO43716 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GATCO43716 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATCO43716 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATCO43716 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATCO43716 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATCO43716 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATCO43716 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATCO43716 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATCO43716 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATCO43716 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATCO43716 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GATCO43716 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GATCO43716 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GATCO43716 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GATCO43716 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATCO43716 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATCO43716 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATCO43716 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATCO43716 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATCO43716 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATCO43716 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATCO43716 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GATCO43716 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GATCO43716 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GATCO43716 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GATCO43716 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GATCO43716 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GATCO43716 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GATCO43716 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GATCO43716 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GATCO43716 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GATCO43716 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GATCO43716 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GATCO43716 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GATCO43716 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GATCO43716 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GATCO43716 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GATCO43716 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GATCO43716 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GATCO43716 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GATCO43716 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GATCO43716 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GATCO43716 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GATCO43716 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GATCO43716 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
GATCO43716 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GATCO43716 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GATCO43716 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GATCO43716 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GATCO43716 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GATCO43716 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GATCO43716 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GATCO43716 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GATCO43716 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GATCO43716 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GATCO43716 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GATCO43716 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GATCO43716 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GATCO43716 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GATCO43716 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GATCO43716 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GATCO43716 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GATCO43716 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GATCO43716 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GATCO43716 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GATCO43716 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GATCO43716 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GATCO43716 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GATCO43716 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GATCO43716 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GATCO43716 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GATCO43716 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GATCO43716 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GATCO43716 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GATCO43716 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GATCO43716 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GATCO43716 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GATCO43716 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GATCO43716 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GATCO43716 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GATCO43716 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GATCO43716 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GATCO43716 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GATCO43716 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GATCO43716 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GATCO43716 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GATCO43716 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GATCO43716 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GATCO43716 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GATCO43716 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GATCO43716 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GATCO43716 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GATCO43716 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.6 ms