RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.86■■■■■ 4.13
OPN3-201ENST00000366554 HRCP23327 699 aa37.01■■■■□ 3.51
OPN3-201ENST00000366554 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
OPN3-201ENST00000366554 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.02■■■■□ 3.36
OPN3-201ENST00000366554 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36■■■■□ 3.35
OPN3-201ENST00000366554 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
OPN3-201ENST00000366554 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
OPN3-201ENST00000366554 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.93■■■■□ 3.34
OPN3-201ENST00000366554 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.67■■■■□ 3.3
OPN3-201ENST00000366554 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.36■■■■□ 3.25
OPN3-201ENST00000366554 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
OPN3-201ENST00000366554 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP34.95■■■■□ 3.19
OPN3-201ENST00000366554 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.92■■■■□ 3.18
OPN3-201ENST00000366554 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
OPN3-201ENST00000366554 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP34.77■■■■□ 3.16
OPN3-201ENST00000366554 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.73■■■■□ 3.15
OPN3-201ENST00000366554 MYT1Q01538 1121 aa34.67■■■■□ 3.14
OPN3-201ENST00000366554 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
OPN3-201ENST00000366554 NEUROD1Q13562 356 aa34.01■■■■□ 3.04
OPN3-201ENST00000366554 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa33.82■■■■□ 3
OPN3-201ENST00000366554 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP33.66■■■□□ 2.98
OPN3-201ENST00000366554 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.6■■■□□ 2.97
OPN3-201ENST00000366554 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP33.45■■■□□ 2.94
OPN3-201ENST00000366554 TRIM41Q8WV44 630 aa33.34■■■□□ 2.93
OPN3-201ENST00000366554 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP33.31■■■□□ 2.92
OPN3-201ENST00000366554 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP33.26■■■□□ 2.92
OPN3-201ENST00000366554 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.19■■■□□ 2.9
OPN3-201ENST00000366554 ABCC9O60706 1549 aa33.12■■■□□ 2.89
OPN3-201ENST00000366554 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.95■■■□□ 2.87
OPN3-201ENST00000366554 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.91■■■□□ 2.86
OPN3-201ENST00000366554 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP32.81■■■□□ 2.84
OPN3-201ENST00000366554 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.79■■■□□ 2.84
OPN3-201ENST00000366554 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP32.73■■■□□ 2.83
OPN3-201ENST00000366554 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.6■■■□□ 2.81
OPN3-201ENST00000366554 MIER1Q8N108 512 aa32.57■■■□□ 2.8
OPN3-201ENST00000366554 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.48■■■□□ 2.79
OPN3-201ENST00000366554 CLSPNQ9HAW4 1339 aa32.3■■■□□ 2.76
OPN3-201ENST00000366554 ANP32EQ9BTT0 268 aa32.29■■■□□ 2.76
OPN3-201ENST00000366554 BCL11AQ9H165 835 aa32.28■■■□□ 2.76
OPN3-201ENST00000366554 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP32.21■■■□□ 2.75
OPN3-201ENST00000366554 SCRIBQ14160 1630 aa32.19■■■□□ 2.74
OPN3-201ENST00000366554 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa32.13■■■□□ 2.73
OPN3-201ENST00000366554 CEP162Q5TB80 1403 aa32.12■■■□□ 2.73
OPN3-201ENST00000366554 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.96■■■□□ 2.71
OPN3-201ENST00000366554 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.96■■■□□ 2.71
OPN3-201ENST00000366554 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.89■■■□□ 2.7
OPN3-201ENST00000366554 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.88■■■□□ 2.69
OPN3-201ENST00000366554 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.88■■■□□ 2.69
OPN3-201ENST00000366554 WIZO95785 1651 aa31.77■■■□□ 2.68
OPN3-201ENST00000366554 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.75■■■□□ 2.67
OPN3-201ENST00000366554 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
OPN3-201ENST00000366554 ABCC8Q09428 1581 aa31.65■■■□□ 2.66
OPN3-201ENST00000366554 SOGA1O94964 1423 aa31.64■■■□□ 2.66
OPN3-201ENST00000366554 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.64■■■□□ 2.66
OPN3-201ENST00000366554 EEA1Q15075 1411 aa31.58■■■□□ 2.65
OPN3-201ENST00000366554 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.56■■■□□ 2.64
OPN3-201ENST00000366554 GOLGA3Q08378 1498 aa31.47■■■□□ 2.63
OPN3-201ENST00000366554 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.42■■■□□ 2.62
OPN3-201ENST00000366554 NACADO15069 1562 aa31.35■■■□□ 2.61
OPN3-201ENST00000366554 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP31.34■■■□□ 2.61
OPN3-201ENST00000366554 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP31.34■■■□□ 2.61
OPN3-201ENST00000366554 BCANQ96GW7 911 aa31.3■■■□□ 2.6
OPN3-201ENST00000366554 VPS8Q8N3P4 1428 aa31.26■■■□□ 2.59
OPN3-201ENST00000366554 FKBP8Q14318 412 aa31.25■■■□□ 2.59
OPN3-201ENST00000366554 CLIP1P30622 1438 aa31.24■■■□□ 2.59
OPN3-201ENST00000366554 KCNH8Q96L42 1107 aa31.22■■■□□ 2.59
OPN3-201ENST00000366554 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
OPN3-201ENST00000366554 SMARCA2P51531 1590 aa31.14■■■□□ 2.58
OPN3-201ENST00000366554 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.14■■■□□ 2.58
OPN3-201ENST00000366554 APLP2Q06481 763 aa31.11■■■□□ 2.57
OPN3-201ENST00000366554 MSH5O43196 834 aa31.09■■■□□ 2.57
OPN3-201ENST00000366554 KIF21BO75037 1637 aa31.09■■■□□ 2.57
OPN3-201ENST00000366554 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP30.99■■■□□ 2.55
OPN3-201ENST00000366554 NEFLP07196 543 aa30.96■■■□□ 2.55
OPN3-201ENST00000366554 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
OPN3-201ENST00000366554 FANCIQ9NVI1 1328 aa30.9■■■□□ 2.54
OPN3-201ENST00000366554 ITGAEP38570 1179 aa30.88■■■□□ 2.53
OPN3-201ENST00000366554 CUX2O14529 1486 aa30.86■■■□□ 2.53
OPN3-201ENST00000366554 SMARCA4P51532 1647 aa30.8■■■□□ 2.52
OPN3-201ENST00000366554 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.78■■■□□ 2.52
OPN3-201ENST00000366554 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.52
OPN3-201ENST00000366554 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
OPN3-201ENST00000366554 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.72■■■□□ 2.51
OPN3-201ENST00000366554 CCER2I3L3R5 266 aa30.68■■■□□ 2.5
OPN3-201ENST00000366554 SYNJ1O43426 1573 aa30.68■■■□□ 2.5
OPN3-201ENST00000366554 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.67■■■□□ 2.5
OPN3-201ENST00000366554 TRIM52Q96A61 297 aa30.66■■■□□ 2.5
OPN3-201ENST00000366554 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
OPN3-201ENST00000366554 ERICH6Q7L0X2 663 aa30.66■■■□□ 2.5
OPN3-201ENST00000366554 MAPKBP1O60336 1514 aa30.62■■■□□ 2.49
OPN3-201ENST00000366554 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
OPN3-201ENST00000366554 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
OPN3-201ENST00000366554 ARAP1Q96P48 1450 aa30.55■■■□□ 2.48
OPN3-201ENST00000366554 DEKP35659 375 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
OPN3-201ENST00000366554 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.54■■■□□ 2.48
OPN3-201ENST00000366554 WDR97A6NE52 1622 aa30.52■■■□□ 2.48
OPN3-201ENST00000366554 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa30.49■■■□□ 2.47
OPN3-201ENST00000366554 ANP32CO43423 234 aa30.46■■■□□ 2.47
OPN3-201ENST00000366554 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.34■■■□□ 2.45
OPN3-201ENST00000366554 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.3 ms