RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403084.1

CLDN5-201, Transcript of claudin 5, humanhuman

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Gene CLDN5, Length 2,357 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5-201ENST00000403084 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.99■■■■■ 4.31
CLDN5-201ENST00000403084 HRCP23327 699 aa36.99■■■■□ 3.51
CLDN5-201ENST00000403084 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.57■■■■□ 3.45
CLDN5-201ENST00000403084 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
CLDN5-201ENST00000403084 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.28■■■■□ 3.4
CLDN5-201ENST00000403084 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.07■■■■□ 3.36
CLDN5-201ENST00000403084 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.03■■■■□ 3.36
CLDN5-201ENST00000403084 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.03■■■■□ 3.36
CLDN5-201ENST00000403084 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
CLDN5-201ENST00000403084 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
CLDN5-201ENST00000403084 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.73■■■■□ 3.31
CLDN5-201ENST00000403084 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
CLDN5-201ENST00000403084 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP35.16■■■■□ 3.22
CLDN5-201ENST00000403084 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.98■■■■□ 3.19
CLDN5-201ENST00000403084 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP34.95■■■■□ 3.19
CLDN5-201ENST00000403084 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP34.82■■■■□ 3.17
CLDN5-201ENST00000403084 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.34■■■■□ 3.09
CLDN5-201ENST00000403084 MYT1Q01538 1121 aa34.28■■■■□ 3.08
CLDN5-201ENST00000403084 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
CLDN5-201ENST00000403084 ABCC9O60706 1549 aa34.02■■■■□ 3.04
CLDN5-201ENST00000403084 NEUROD1Q13562 356 aa33.9■■■■□ 3.02
CLDN5-201ENST00000403084 TRIM41Q8WV44 630 aa33.82■■■■□ 3
CLDN5-201ENST00000403084 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa33.68■■■□□ 2.98
CLDN5-201ENST00000403084 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.67■■■□□ 2.98
CLDN5-201ENST00000403084 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP33.67■■■□□ 2.98
CLDN5-201ENST00000403084 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.57■■■□□ 2.96
CLDN5-201ENST00000403084 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.54■■■□□ 2.96
CLDN5-201ENST00000403084 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP33.5■■■□□ 2.95
CLDN5-201ENST00000403084 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP33.46■■■□□ 2.95
CLDN5-201ENST00000403084 NACADO15069 1562 aa33.46■■■□□ 2.95
CLDN5-201ENST00000403084 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP33.45■■■□□ 2.95
CLDN5-201ENST00000403084 SCRIBQ14160 1630 aa33.28■■■□□ 2.92
CLDN5-201ENST00000403084 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.21■■■□□ 2.91
CLDN5-201ENST00000403084 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.98■■■□□ 2.87
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP32.96■■■□□ 2.87
CLDN5-201ENST00000403084 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.79■■■□□ 2.84
CLDN5-201ENST00000403084 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP32.72■■■□□ 2.83
CLDN5-201ENST00000403084 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.71■■■□□ 2.83
CLDN5-201ENST00000403084 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.67■■■□□ 2.82
CLDN5-201ENST00000403084 WIZO95785 1651 aa32.63■■■□□ 2.81
CLDN5-201ENST00000403084 CEP162Q5TB80 1403 aa32.63■■■□□ 2.81
CLDN5-201ENST00000403084 MIER1Q8N108 512 aa32.62■■■□□ 2.81
CLDN5-201ENST00000403084 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.55■■■□□ 2.8
CLDN5-201ENST00000403084 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.5■■■□□ 2.79
CLDN5-201ENST00000403084 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.49■■■□□ 2.79
CLDN5-201ENST00000403084 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.44■■■□□ 2.78
CLDN5-201ENST00000403084 CLSPNQ9HAW4 1339 aa32.42■■■□□ 2.78
CLDN5-201ENST00000403084 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.36■■■□□ 2.77
CLDN5-201ENST00000403084 ABCC8Q09428 1581 aa32.3■■■□□ 2.76
CLDN5-201ENST00000403084 EEA1Q15075 1411 aa32.27■■■□□ 2.76
CLDN5-201ENST00000403084 SOGA1O94964 1423 aa32.2■■■□□ 2.75
CLDN5-201ENST00000403084 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
CLDN5-201ENST00000403084 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.11■■■□□ 2.73
CLDN5-201ENST00000403084 GOLGA3Q08378 1498 aa32.11■■■□□ 2.73
CLDN5-201ENST00000403084 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.09■■■□□ 2.73
CLDN5-201ENST00000403084 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.08■■■□□ 2.73
CLDN5-201ENST00000403084 ANP32EQ9BTT0 268 aa32.07■■■□□ 2.72
CLDN5-201ENST00000403084 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP32.03■■■□□ 2.72
CLDN5-201ENST00000403084 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.03■■■□□ 2.72
CLDN5-201ENST00000403084 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa32.01■■■□□ 2.72
CLDN5-201ENST00000403084 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32■■■□□ 2.71
CLDN5-201ENST00000403084 SMARCA2P51531 1590 aa31.99■■■□□ 2.71
CLDN5-201ENST00000403084 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.99■■■□□ 2.71
CLDN5-201ENST00000403084 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.94■■■□□ 2.7
CLDN5-201ENST00000403084 SMARCA4P51532 1647 aa31.91■■■□□ 2.7
CLDN5-201ENST00000403084 BCL11AQ9H165 835 aa31.83■■■□□ 2.69
CLDN5-201ENST00000403084 KIF21BO75037 1637 aa31.83■■■□□ 2.69
CLDN5-201ENST00000403084 VPS8Q8N3P4 1428 aa31.81■■■□□ 2.68
CLDN5-201ENST00000403084 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.79■■■□□ 2.68
CLDN5-201ENST00000403084 CLIP1P30622 1438 aa31.75■■■□□ 2.67
CLDN5-201ENST00000403084 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP31.7■■■□□ 2.67
CLDN5-201ENST00000403084 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
CLDN5-201ENST00000403084 APLP2Q06481 763 aa31.57■■■□□ 2.64
CLDN5-201ENST00000403084 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.48■■■□□ 2.63
CLDN5-201ENST00000403084 SYNJ1O43426 1573 aa31.44■■■□□ 2.62
CLDN5-201ENST00000403084 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.37■■■□□ 2.61
CLDN5-201ENST00000403084 CUX2O14529 1486 aa31.36■■■□□ 2.61
CLDN5-201ENST00000403084 KCNH8Q96L42 1107 aa31.28■■■□□ 2.6
CLDN5-201ENST00000403084 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
CLDN5-201ENST00000403084 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.27■■■□□ 2.6
CLDN5-201ENST00000403084 FKBP8Q14318 412 aa31.27■■■□□ 2.6
CLDN5-201ENST00000403084 BCANQ96GW7 911 aa31.27■■■□□ 2.6
CLDN5-201ENST00000403084 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP31.25■■■□□ 2.59
CLDN5-201ENST00000403084 ARAP1Q96P48 1450 aa31.16■■■□□ 2.58
CLDN5-201ENST00000403084 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.09■■■□□ 2.57
CLDN5-201ENST00000403084 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
CLDN5-201ENST00000403084 NEFLP07196 543 aa31.07■■■□□ 2.56
CLDN5-201ENST00000403084 MAPKBP1O60336 1514 aa31.05■■■□□ 2.56
CLDN5-201ENST00000403084 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
CLDN5-201ENST00000403084 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.01■■■□□ 2.55
CLDN5-201ENST00000403084 TOP2BQ02880 1626 aa30.96■■■□□ 2.55
CLDN5-201ENST00000403084 PRXQ9BXM0 1461 aa30.96■■■□□ 2.55
CLDN5-201ENST00000403084 MSH5O43196 834 aa30.95■■■□□ 2.55
CLDN5-201ENST00000403084 CCER2I3L3R5 266 aa30.91■■■□□ 2.54
CLDN5-201ENST00000403084 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
CLDN5-201ENST00000403084 NCAPD3P42695 1498 aa30.9■■■□□ 2.54
CLDN5-201ENST00000403084 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
CLDN5-201ENST00000403084 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa30.89■■■□□ 2.54
CLDN5-201ENST00000403084 WDR97A6NE52 1622 aa30.89■■■□□ 2.54
CLDN5-201ENST00000403084 FANCIQ9NVI1 1328 aa30.88■■■□□ 2.53
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