Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPN9O14815 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPN9O14815 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPN9O14815 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAPN9O14815 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CAPN9O14815 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAPN9O14815 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAPN9O14815 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPN9O14815 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPN9O14815 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPN9O14815 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPN9O14815 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPN9O14815 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPN9O14815 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPN9O14815 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPN9O14815 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPN9O14815 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPN9O14815 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPN9O14815 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPN9O14815 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAPN9O14815 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAPN9O14815 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPN9O14815 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPN9O14815 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPN9O14815 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN9O14815 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN9O14815 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN9O14815 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN9O14815 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPN9O14815 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPN9O14815 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPN9O14815 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPN9O14815 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPN9O14815 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPN9O14815 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPN9O14815 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPN9O14815 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPN9O14815 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPN9O14815 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPN9O14815 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPN9O14815 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPN9O14815 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAPN9O14815 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAPN9O14815 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAPN9O14815 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPN9O14815 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPN9O14815 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPN9O14815 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPN9O14815 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPN9O14815 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPN9O14815 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPN9O14815 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPN9O14815 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPN9O14815 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPN9O14815 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPN9O14815 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPN9O14815 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPN9O14815 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPN9O14815 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPN9O14815 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPN9O14815 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPN9O14815 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPN9O14815 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPN9O14815 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPN9O14815 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPN9O14815 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPN9O14815 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPN9O14815 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPN9O14815 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPN9O14815 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPN9O14815 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPN9O14815 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPN9O14815 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPN9O14815 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPN9O14815 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAPN9O14815 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAPN9O14815 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPN9O14815 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPN9O14815 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPN9O14815 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPN9O14815 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPN9O14815 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPN9O14815 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPN9O14815 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPN9O14815 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPN9O14815 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPN9O14815 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPN9O14815 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CAPN9O14815 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPN9O14815 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CAPN9O14815 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPN9O14815 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAPN9O14815 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CAPN9O14815 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CAPN9O14815 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPN9O14815 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPN9O14815 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPN9O14815 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAPN9O14815 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAPN9O14815 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms