Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CAPN9O14815 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CAPN9O14815 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
CAPN9O14815 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CAPN9O14815 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CAPN9O14815 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CAPN9O14815 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CAPN9O14815 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CAPN9O14815 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CAPN9O14815 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CAPN9O14815 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CAPN9O14815 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CAPN9O14815 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CAPN9O14815 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CAPN9O14815 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CAPN9O14815 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CAPN9O14815 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CAPN9O14815 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CAPN9O14815 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
CAPN9O14815 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CAPN9O14815 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CAPN9O14815 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CAPN9O14815 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CAPN9O14815 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CAPN9O14815 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CAPN9O14815 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CAPN9O14815 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CAPN9O14815 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CAPN9O14815 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CAPN9O14815 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CAPN9O14815 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CAPN9O14815 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CAPN9O14815 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CAPN9O14815 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CAPN9O14815 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CAPN9O14815 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CAPN9O14815 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CAPN9O14815 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CAPN9O14815 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CAPN9O14815 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CAPN9O14815 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CAPN9O14815 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CAPN9O14815 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CAPN9O14815 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CAPN9O14815 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CAPN9O14815 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CAPN9O14815 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CAPN9O14815 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CAPN9O14815 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CAPN9O14815 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CAPN9O14815 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CAPN9O14815 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CAPN9O14815 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
CAPN9O14815 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CAPN9O14815 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CAPN9O14815 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CAPN9O14815 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CAPN9O14815 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CAPN9O14815 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CAPN9O14815 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CAPN9O14815 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CAPN9O14815 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CAPN9O14815 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CAPN9O14815 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CAPN9O14815 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CAPN9O14815 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CAPN9O14815 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CAPN9O14815 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CAPN9O14815 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
CAPN9O14815 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CAPN9O14815 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CAPN9O14815 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CAPN9O14815 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CAPN9O14815 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CAPN9O14815 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
CAPN9O14815 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CAPN9O14815 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CAPN9O14815 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CAPN9O14815 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CAPN9O14815 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CAPN9O14815 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CAPN9O14815 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CAPN9O14815 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CAPN9O14815 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CAPN9O14815 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CAPN9O14815 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CAPN9O14815 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CAPN9O14815 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CAPN9O14815 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CAPN9O14815 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CAPN9O14815 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CAPN9O14815 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CAPN9O14815 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CAPN9O14815 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CAPN9O14815 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CAPN9O14815 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
CAPN9O14815 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CAPN9O14815 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CAPN9O14815 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CAPN9O14815 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms