Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOP58Q9Y2X3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms