RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620299.4

TFG-210, Transcript of TRK-fused gene, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TFG, Length 1,289 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFG-210ENST00000620299 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.43■■■■■ 5.82
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TFG-210ENST00000620299 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.57■■■■■ 4.57
TFG-210ENST00000620299 NACADO15069 1562 aa43.37■■■■■ 4.53
TFG-210ENST00000620299 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.12■■■■■ 4.49
TFG-210ENST00000620299 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.94■■■■■ 4.46
TFG-210ENST00000620299 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.87■■■■■ 4.45
TFG-210ENST00000620299 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.67■■■■■ 4.42
TFG-210ENST00000620299 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.59■■■■■ 4.41
TFG-210ENST00000620299 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.54■■■■■ 4.4
TFG-210ENST00000620299 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.51■■■■■ 4.4
TFG-210ENST00000620299 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.35■■■■■ 4.37
TFG-210ENST00000620299 SCRIBQ14160 1630 aa41.87■■■■■ 4.29
TFG-210ENST00000620299 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.81■■■■■ 4.28
TFG-210ENST00000620299 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
TFG-210ENST00000620299 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.23■■■■■ 4.19
TFG-210ENST00000620299 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.06■■■■■ 4.16
TFG-210ENST00000620299 NCAPD3P42695 1498 aa40.07■■■■■ 4
TFG-210ENST00000620299 SMARCA4P51532 1647 aa40.01■■■■■ 4
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TFG-210ENST00000620299 SMARCA2P51531 1590 aa39.86■■■■□ 3.97
TFG-210ENST00000620299 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.86■■■■□ 3.97
TFG-210ENST00000620299 HMGXB3Q12766 1538 aa39.79■■■■□ 3.96
TFG-210ENST00000620299 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.66■■■■□ 3.94
TFG-210ENST00000620299 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.6■■■■□ 3.93
TFG-210ENST00000620299 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.57■■■■□ 3.93
TFG-210ENST00000620299 ERCC6Q03468 1493 aa39.32■■■■□ 3.89
TFG-210ENST00000620299 NESP48681 1621 aa39.29■■■■□ 3.88
TFG-210ENST00000620299 CUX2O14529 1486 aa39.2■■■■□ 3.87
TFG-210ENST00000620299 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.17■■■■□ 3.86
TFG-210ENST00000620299 WIZO95785 1651 aa39.12■■■■□ 3.85
TFG-210ENST00000620299 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.08■■■■□ 3.85
TFG-210ENST00000620299 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.85■■■■□ 3.81
TFG-210ENST00000620299 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.84■■■■□ 3.81
TFG-210ENST00000620299 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.83■■■■□ 3.81
TFG-210ENST00000620299 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.79■■■■□ 3.8
TFG-210ENST00000620299 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.78■■■■□ 3.8
TFG-210ENST00000620299 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.77■■■■□ 3.8
TFG-210ENST00000620299 CFTRP13569 1480 aa38.48■■■■□ 3.75
TFG-210ENST00000620299 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.48■■■■□ 3.75
TFG-210ENST00000620299 WDR62O43379 1518 aa38.4■■■■□ 3.74
TFG-210ENST00000620299 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.39■■■■□ 3.74
TFG-210ENST00000620299 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.38■■■■□ 3.73
TFG-210ENST00000620299 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.29■■■■□ 3.72
TFG-210ENST00000620299 PRDM2Q13029 1718 aa38.08■■■■□ 3.69
TFG-210ENST00000620299 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.07■■■■□ 3.69
TFG-210ENST00000620299 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.9■■■■□ 3.66
TFG-210ENST00000620299 TOPBP1Q92547 1522 aa37.71■■■■□ 3.63
TFG-210ENST00000620299 ABCC8Q09428 1581 aa37.63■■■■□ 3.62
TFG-210ENST00000620299 IFT140Q96RY7 1462 aa37.62■■■■□ 3.61
TFG-210ENST00000620299 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.59■■■■□ 3.61
TFG-210ENST00000620299 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.53■■■■□ 3.6
TFG-210ENST00000620299 OSCARQ8IYS5 282 aa37.43■■■■□ 3.58
TFG-210ENST00000620299 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.36■■■■□ 3.57
TFG-210ENST00000620299 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.35■■■■□ 3.57
TFG-210ENST00000620299 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.34■■■■□ 3.57
TFG-210ENST00000620299 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.23■■■■□ 3.551e-6■■■□□ 15
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TFG-210ENST00000620299 CUX1P39880 1505 aa37.19■■■■□ 3.54
TFG-210ENST00000620299 TRIM41Q8WV44 630 aa37.16■■■■□ 3.54
TFG-210ENST00000620299 SOGA1O94964 1423 aa37.16■■■■□ 3.54
TFG-210ENST00000620299 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.15■■■■□ 3.54
TFG-210ENST00000620299 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.04■■■■□ 3.52
TFG-210ENST00000620299 WDR97A6NE52 1622 aa37■■■■□ 3.51
TFG-210ENST00000620299 CHD1O14646 1710 aa36.97■■■■□ 3.51
TFG-210ENST00000620299 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.92■■■■□ 3.5
TFG-210ENST00000620299 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.92■■■■□ 3.5
TFG-210ENST00000620299 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.92■■■■□ 3.5
TFG-210ENST00000620299 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.88■■■■□ 3.49
TFG-210ENST00000620299 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.86■■■■□ 3.49
TFG-210ENST00000620299 ARHGEF11O15085 1522 aa36.85■■■■□ 3.49
TFG-210ENST00000620299 FBLN2P98095 1184 aa36.84■■■■□ 3.49
TFG-210ENST00000620299 TOP2BQ02880 1626 aa36.83■■■■□ 3.49
TFG-210ENST00000620299 GRIN2BQ13224 1484 aa36.82■■■■□ 3.48
TFG-210ENST00000620299 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.81■■■■□ 3.48
TFG-210ENST00000620299 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.78■■■■□ 3.48
TFG-210ENST00000620299 SYNJ1O43426 1573 aa36.78■■■■□ 3.48
TFG-210ENST00000620299 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.77■■■■□ 3.48
TFG-210ENST00000620299 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.72■■■■□ 3.47
TFG-210ENST00000620299 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.68■■■■□ 3.46
TFG-210ENST00000620299 PBRM1Q86U86 1689 aa36.67■■■■□ 3.46
TFG-210ENST00000620299 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.66■■■■□ 3.46
TFG-210ENST00000620299 SYNJ2O15056 1496 aa36.65■■■■□ 3.46
TFG-210ENST00000620299 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.61■■■■□ 3.45
TFG-210ENST00000620299 ARAP1Q96P48 1450 aa36.53■■■■□ 3.44
TFG-210ENST00000620299 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.52■■■■□ 3.44
TFG-210ENST00000620299 ADAMTS12P58397 1594 aa36.37■■■■□ 3.41
TFG-210ENST00000620299 GRIN2AQ12879 1464 aa36.34■■■■□ 3.41
TFG-210ENST00000620299 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.31■■■■□ 3.4
TFG-210ENST00000620299 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.28■■■■□ 3.4
TFG-210ENST00000620299 NUP160Q12769 1436 aa36.24■■■■□ 3.39
TFG-210ENST00000620299 CEP170Q5SW79 1584 aa36.2■■■■□ 3.39
TFG-210ENST00000620299 KIF27Q86VH2 1401 aa36.11■■■■□ 3.37
TFG-210ENST00000620299 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.06■■■■□ 3.36
TFG-210ENST00000620299 SHROOM2Q13796 1616 aa36.03■■■■□ 3.36
TFG-210ENST00000620299 IGF1RP08069 1367 aa36.02■■■■□ 3.36
TFG-210ENST00000620299 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.97■■■■□ 3.35
TFG-210ENST00000620299 CUL7Q14999 1698 aa35.87■■■■□ 3.33
TFG-210ENST00000620299 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.85■■■■□ 3.33
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