RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355765.10

PRPF39-201, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRPF39, Length 2,868 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-201ENST00000355765 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.07■■■■□ 3.36
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PRPF39-201ENST00000355765 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.56■■■□□ 2.48
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PRPF39-201ENST00000355765 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
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PRPF39-201ENST00000355765 MIER1Q8N108 512 aa28.37■■■□□ 2.13
PRPF39-201ENST00000355765 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.21■■■□□ 2.11
PRPF39-201ENST00000355765 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.18■■■□□ 2.1
PRPF39-201ENST00000355765 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.14■■■□□ 2.09
PRPF39-201ENST00000355765 CEP162Q5TB80 1403 aa28.11■■■□□ 2.09
PRPF39-201ENST00000355765 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.11■■■□□ 2.09
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PRPF39-201ENST00000355765 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.68■■□□□ 1.86
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PRPF39-201ENST00000355765 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.67■■□□□ 1.86
PRPF39-201ENST00000355765 MAPKBP1O60336 1514 aa26.67■■□□□ 1.86
PRPF39-201ENST00000355765 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
PRPF39-201ENST00000355765 WDR97A6NE52 1622 aa26.65■■□□□ 1.86
PRPF39-201ENST00000355765 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.64■■□□□ 1.86
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