RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223271.7

RARRES2-201, Transcript of retinoic acid receptor responder 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RARRES2, Length 740 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES2-201ENST00000223271 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.04■■■■■ 5.6
RARRES2-201ENST00000223271 ABCC9O60706 1549 aa44.77■■■■■ 4.76
RARRES2-201ENST00000223271 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.68■■■■■ 4.74
RARRES2-201ENST00000223271 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.59■■■■■ 4.41
RARRES2-201ENST00000223271 NACADO15069 1562 aa42.28■■■■■ 4.36
RARRES2-201ENST00000223271 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.07■■■■■ 4.33
RARRES2-201ENST00000223271 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.03■■■■■ 4.32
RARRES2-201ENST00000223271 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
RARRES2-201ENST00000223271 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.7■■■■■ 4.27
RARRES2-201ENST00000223271 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.68■■■■■ 4.263e-7■■■■■ 31.8
RARRES2-201ENST00000223271 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.56■■■■■ 4.24
RARRES2-201ENST00000223271 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.53■■■■■ 4.24
RARRES2-201ENST00000223271 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.34■■■■■ 4.21
RARRES2-201ENST00000223271 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.83■■■■■ 4.13
RARRES2-201ENST00000223271 SCRIBQ14160 1630 aa40.71■■■■■ 4.11
RARRES2-201ENST00000223271 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.43■■■■■ 4.06
RARRES2-201ENST00000223271 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.35■■■■■ 4.05
RARRES2-201ENST00000223271 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.35■■■■■ 4.05
RARRES2-201ENST00000223271 NCAPD3P42695 1498 aa39.05■■■■□ 3.84
RARRES2-201ENST00000223271 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.92■■■■□ 3.82
RARRES2-201ENST00000223271 SMARCA4P51532 1647 aa38.84■■■■□ 3.81
RARRES2-201ENST00000223271 SMARCA2P51531 1590 aa38.79■■■■□ 3.8
RARRES2-201ENST00000223271 HMGXB3Q12766 1538 aa38.74■■■■□ 3.79
RARRES2-201ENST00000223271 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.74■■■■□ 3.79
RARRES2-201ENST00000223271 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.71■■■■□ 3.79
RARRES2-201ENST00000223271 ERCC6Q03468 1493 aa38.67■■■■□ 3.78
RARRES2-201ENST00000223271 CUX2O14529 1486 aa38.64■■■■□ 3.78
RARRES2-201ENST00000223271 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.54■■■■□ 3.76
RARRES2-201ENST00000223271 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.52■■■■□ 3.76
RARRES2-201ENST00000223271 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.48■■■■□ 3.75
RARRES2-201ENST00000223271 NESP48681 1621 aa38.44■■■■□ 3.74
RARRES2-201ENST00000223271 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.32■■■■□ 3.73
RARRES2-201ENST00000223271 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.17■■■■□ 3.7
RARRES2-201ENST00000223271 WIZO95785 1651 aa38.08■■■■□ 3.69
RARRES2-201ENST00000223271 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.06■■■■□ 3.68
RARRES2-201ENST00000223271 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.97■■■■□ 3.67
RARRES2-201ENST00000223271 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.9■■■■□ 3.66
RARRES2-201ENST00000223271 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.86■■■■□ 3.65
RARRES2-201ENST00000223271 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.78■■■■□ 3.64
RARRES2-201ENST00000223271 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.64■■■■□ 3.62
RARRES2-201ENST00000223271 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.59■■■■□ 3.61
RARRES2-201ENST00000223271 WDR62O43379 1518 aa37.54■■■■□ 3.6
RARRES2-201ENST00000223271 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.47■■■■□ 3.59
RARRES2-201ENST00000223271 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.42■■■■□ 3.58
RARRES2-201ENST00000223271 CFTRP13569 1480 aa37.41■■■■□ 3.58
RARRES2-201ENST00000223271 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.33■■■■□ 3.57
RARRES2-201ENST00000223271 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.11■■■■□ 3.53
RARRES2-201ENST00000223271 TRIM41Q8WV44 630 aa36.96■■■■□ 3.51
RARRES2-201ENST00000223271 PRDM2Q13029 1718 aa36.96■■■■□ 3.51
RARRES2-201ENST00000223271 OSCARQ8IYS5 282 aa36.86■■■■□ 3.49
RARRES2-201ENST00000223271 IFT140Q96RY7 1462 aa36.74■■■■□ 3.47
RARRES2-201ENST00000223271 TOPBP1Q92547 1522 aa36.69■■■■□ 3.46
RARRES2-201ENST00000223271 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.67■■■■□ 3.46
RARRES2-201ENST00000223271 ABCC8Q09428 1581 aa36.63■■■■□ 3.45
RARRES2-201ENST00000223271 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.56■■■■□ 3.44
RARRES2-201ENST00000223271 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
RARRES2-201ENST00000223271 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
RARRES2-201ENST00000223271 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.36■■■■□ 3.41
RARRES2-201ENST00000223271 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.36■■■■□ 3.41
RARRES2-201ENST00000223271 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.36■■■■□ 3.41
RARRES2-201ENST00000223271 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.32■■■■□ 3.411e-6■■■■□ 21.9
RARRES2-201ENST00000223271 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.32■■■■□ 3.41
RARRES2-201ENST00000223271 ARHGEF11O15085 1522 aa36.26■■■■□ 3.4
RARRES2-201ENST00000223271 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.18■■■■□ 3.38
RARRES2-201ENST00000223271 CHD1O14646 1710 aa36.16■■■■□ 3.38
RARRES2-201ENST00000223271 SOGA1O94964 1423 aa36.16■■■■□ 3.38
RARRES2-201ENST00000223271 CUX1P39880 1505 aa36.11■■■■□ 3.37
RARRES2-201ENST00000223271 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
RARRES2-201ENST00000223271 FBLN2P98095 1184 aa36.09■■■■□ 3.37
RARRES2-201ENST00000223271 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.08■■■■□ 3.37
RARRES2-201ENST00000223271 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.08■■■■□ 3.37
RARRES2-201ENST00000223271 WDR97A6NE52 1622 aa36.02■■■■□ 3.36
RARRES2-201ENST00000223271 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.99■■■■□ 3.35
RARRES2-201ENST00000223271 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.97■■■■□ 3.35
RARRES2-201ENST00000223271 TOP2BQ02880 1626 aa35.97■■■■□ 3.35
RARRES2-201ENST00000223271 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.96■■■■□ 3.35
RARRES2-201ENST00000223271 SYNJ1O43426 1573 aa35.93■■■■□ 3.34
RARRES2-201ENST00000223271 ARAP1Q96P48 1450 aa35.91■■■■□ 3.34
RARRES2-201ENST00000223271 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.87■■■■□ 3.33
RARRES2-201ENST00000223271 GRIN2BQ13224 1484 aa35.86■■■■□ 3.33
RARRES2-201ENST00000223271 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.84■■■■□ 3.33
RARRES2-201ENST00000223271 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.8■■■■□ 3.32
RARRES2-201ENST00000223271 SYNJ2O15056 1496 aa35.75■■■■□ 3.31
RARRES2-201ENST00000223271 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.73■■■■□ 3.31
RARRES2-201ENST00000223271 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.67■■■■□ 3.3
RARRES2-201ENST00000223271 PBRM1Q86U86 1689 aa35.66■■■■□ 3.3
RARRES2-201ENST00000223271 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.62■■■■□ 3.29
RARRES2-201ENST00000223271 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.61■■■■□ 3.29
RARRES2-201ENST00000223271 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.52■■■■□ 3.28
RARRES2-201ENST00000223271 GRIN2AQ12879 1464 aa35.4■■■■□ 3.26
RARRES2-201ENST00000223271 ADAMTS12P58397 1594 aa35.36■■■■□ 3.25
RARRES2-201ENST00000223271 KIF27Q86VH2 1401 aa35.31■■■■□ 3.24
RARRES2-201ENST00000223271 NUP160Q12769 1436 aa35.3■■■■□ 3.24
RARRES2-201ENST00000223271 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.28■■■■□ 3.24
RARRES2-201ENST00000223271 CEP170Q5SW79 1584 aa35.25■■■■□ 3.23
RARRES2-201ENST00000223271 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.23■■■■□ 3.23
RARRES2-201ENST00000223271 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.21■■■■□ 3.23
RARRES2-201ENST00000223271 IGF1RP08069 1367 aa35.13■■■■□ 3.21
RARRES2-201ENST00000223271 SHROOM2Q13796 1616 aa35.11■■■■□ 3.21
RARRES2-201ENST00000223271 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.07■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms