RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258424.2

COX5B-201, Transcript of cytochrome c oxidase subunit 5B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COX5B, Length 712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5B-201ENST00000258424 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.01■■■■■ 5.76
COX5B-201ENST00000258424 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.31■■■■■ 4.84
COX5B-201ENST00000258424 ABCC9O60706 1549 aa44.79■■■■■ 4.76
COX5B-201ENST00000258424 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.65■■■■■ 4.42
COX5B-201ENST00000258424 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.55■■■■■ 4.4
COX5B-201ENST00000258424 NACADO15069 1562 aa42.49■■■■■ 4.39
COX5B-201ENST00000258424 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.46■■■■■ 4.39
COX5B-201ENST00000258424 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.29■■■■■ 4.36
COX5B-201ENST00000258424 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.19■■■■■ 4.34
COX5B-201ENST00000258424 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.97■■■■■ 4.31
COX5B-201ENST00000258424 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.84■■■■■ 4.294e-8■□□□□ 9.7
COX5B-201ENST00000258424 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.71■■■■■ 4.27
COX5B-201ENST00000258424 SCRIBQ14160 1630 aa41.38■■■■■ 4.21
COX5B-201ENST00000258424 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.36■■■■■ 4.21
COX5B-201ENST00000258424 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.86■■■■■ 4.13
COX5B-201ENST00000258424 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.4■■■■■ 4.06
COX5B-201ENST00000258424 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.36■■■■■ 4.05
COX5B-201ENST00000258424 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.34■■■■■ 4.05
COX5B-201ENST00000258424 SMARCA4P51532 1647 aa39.58■■■■□ 3.93
COX5B-201ENST00000258424 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.51■■■■□ 3.92
COX5B-201ENST00000258424 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.35■■■■□ 3.89
COX5B-201ENST00000258424 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.27■■■■□ 3.88
COX5B-201ENST00000258424 SMARCA2P51531 1590 aa39.22■■■■□ 3.87
COX5B-201ENST00000258424 NCAPD3P42695 1498 aa39.21■■■■□ 3.87
COX5B-201ENST00000258424 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.17■■■■□ 3.86
COX5B-201ENST00000258424 HMGXB3Q12766 1538 aa39.06■■■■□ 3.84
COX5B-201ENST00000258424 WIZO95785 1651 aa38.97■■■■□ 3.83
COX5B-201ENST00000258424 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.95■■■■□ 3.83
COX5B-201ENST00000258424 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.92■■■■□ 3.82
COX5B-201ENST00000258424 ERCC6Q03468 1493 aa38.68■■■■□ 3.78
COX5B-201ENST00000258424 CUX2O14529 1486 aa38.54■■■■□ 3.76
COX5B-201ENST00000258424 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.52■■■■□ 3.76
COX5B-201ENST00000258424 NESP48681 1621 aa38.5■■■■□ 3.75
COX5B-201ENST00000258424 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.46■■■■□ 3.75
COX5B-201ENST00000258424 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.23■■■■□ 3.71
COX5B-201ENST00000258424 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.12■■■■□ 3.69
COX5B-201ENST00000258424 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.06■■■■□ 3.68
COX5B-201ENST00000258424 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.04■■■■□ 3.68
COX5B-201ENST00000258424 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.01■■■■□ 3.68
COX5B-201ENST00000258424 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.97■■■■□ 3.67
COX5B-201ENST00000258424 CFTRP13569 1480 aa37.89■■■■□ 3.66
COX5B-201ENST00000258424 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.88■■■■□ 3.66
COX5B-201ENST00000258424 PRDM2Q13029 1718 aa37.74■■■■□ 3.63
COX5B-201ENST00000258424 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.71■■■■□ 3.63
COX5B-201ENST00000258424 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.64■■■■□ 3.62
COX5B-201ENST00000258424 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.59■■■■□ 3.61
COX5B-201ENST00000258424 WDR62O43379 1518 aa37.56■■■■□ 3.6
COX5B-201ENST00000258424 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.31■■■■□ 3.56
COX5B-201ENST00000258424 TOPBP1Q92547 1522 aa37.09■■■■□ 3.53
COX5B-201ENST00000258424 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.08■■■■□ 3.53
COX5B-201ENST00000258424 ABCC8Q09428 1581 aa37■■■■□ 3.51
COX5B-201ENST00000258424 OSCARQ8IYS5 282 aa36.96■■■■□ 3.51
COX5B-201ENST00000258424 CUX1P39880 1505 aa36.9■■■■□ 3.5
COX5B-201ENST00000258424 IFT140Q96RY7 1462 aa36.86■■■■□ 3.49
COX5B-201ENST00000258424 TRIM41Q8WV44 630 aa36.85■■■■□ 3.49
COX5B-201ENST00000258424 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.79■■■■□ 3.48
COX5B-201ENST00000258424 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.75■■■■□ 3.47
COX5B-201ENST00000258424 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.73■■■■□ 3.47
COX5B-201ENST00000258424 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.71■■■■□ 3.47
COX5B-201ENST00000258424 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.68■■■■□ 3.46
COX5B-201ENST00000258424 SYNJ1O43426 1573 aa36.66■■■■□ 3.46
COX5B-201ENST00000258424 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.65■■■■□ 3.46
COX5B-201ENST00000258424 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.63■■■■□ 3.45
COX5B-201ENST00000258424 TOP2BQ02880 1626 aa36.63■■■■□ 3.45
COX5B-201ENST00000258424 SOGA1O94964 1423 aa36.59■■■■□ 3.45
COX5B-201ENST00000258424 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
COX5B-201ENST00000258424 WDR97A6NE52 1622 aa36.5■■■■□ 3.43
COX5B-201ENST00000258424 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.5■■■■□ 3.435e-9■■■■■ 37.5
COX5B-201ENST00000258424 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
COX5B-201ENST00000258424 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.36■■■■□ 3.41
COX5B-201ENST00000258424 FBLN2P98095 1184 aa36.33■■■■□ 3.41
COX5B-201ENST00000258424 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.26■■■■□ 3.4
COX5B-201ENST00000258424 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.23■■■■□ 3.39
COX5B-201ENST00000258424 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.23■■■■□ 3.39
COX5B-201ENST00000258424 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.23■■■■□ 3.39
COX5B-201ENST00000258424 PBRM1Q86U86 1689 aa36.21■■■■□ 3.39
COX5B-201ENST00000258424 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.19■■■■□ 3.38
COX5B-201ENST00000258424 ARHGEF11O15085 1522 aa36.18■■■■□ 3.38
COX5B-201ENST00000258424 GRIN2BQ13224 1484 aa36.15■■■■□ 3.38
COX5B-201ENST00000258424 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.12■■■■□ 3.37
COX5B-201ENST00000258424 CHD1O14646 1710 aa36.11■■■■□ 3.37
COX5B-201ENST00000258424 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
COX5B-201ENST00000258424 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.07■■■■□ 3.36
COX5B-201ENST00000258424 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
COX5B-201ENST00000258424 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.93■■■■□ 3.34
COX5B-201ENST00000258424 SYNJ2O15056 1496 aa35.91■■■■□ 3.34
COX5B-201ENST00000258424 ADAMTS12P58397 1594 aa35.9■■■■□ 3.34
COX5B-201ENST00000258424 KIF27Q86VH2 1401 aa35.86■■■■□ 3.33
COX5B-201ENST00000258424 ARAP1Q96P48 1450 aa35.84■■■■□ 3.33
COX5B-201ENST00000258424 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.79■■■■□ 3.32
COX5B-201ENST00000258424 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.76■■■■□ 3.32
COX5B-201ENST00000258424 GRIN2AQ12879 1464 aa35.72■■■■□ 3.31
COX5B-201ENST00000258424 IGF1RP08069 1367 aa35.71■■■■□ 3.31
COX5B-201ENST00000258424 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.69■■■■□ 3.3
COX5B-201ENST00000258424 CUL7Q14999 1698 aa35.67■■■■□ 3.3
COX5B-201ENST00000258424 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
COX5B-201ENST00000258424 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.6■■■■□ 3.29
COX5B-201ENST00000258424 CEP170Q5SW79 1584 aa35.59■■■■□ 3.29
COX5B-201ENST00000258424 NUP160Q12769 1436 aa35.55■■■■□ 3.28
COX5B-201ENST00000258424 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.49■■■■□ 3.27
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