RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414141.1

LINC01816-201, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1816, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LINC01816, Length 662 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01816-201ENST00000414141 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.67■■■■■ 5.7
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LINC01816-201ENST00000414141 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.27■■■■■ 4.36
LINC01816-201ENST00000414141 NACADO15069 1562 aa42.27■■■■■ 4.36
LINC01816-201ENST00000414141 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.24■■■■■ 4.35
LINC01816-201ENST00000414141 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.24■■■■■ 4.35
LINC01816-201ENST00000414141 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.09■■■■■ 4.33
LINC01816-201ENST00000414141 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.98■■■■■ 4.31
LINC01816-201ENST00000414141 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.27■■■■■ 4.2
LINC01816-201ENST00000414141 SCRIBQ14160 1630 aa41.02■■■■■ 4.16
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LINC01816-201ENST00000414141 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.62■■■■□ 3.93
LINC01816-201ENST00000414141 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.37■■■■□ 3.89
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LINC01816-201ENST00000414141 SMARCA2P51531 1590 aa39.02■■■■□ 3.84
LINC01816-201ENST00000414141 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.01■■■■□ 3.84
LINC01816-201ENST00000414141 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.98■■■■□ 3.83
LINC01816-201ENST00000414141 NCAPD3P42695 1498 aa38.96■■■■□ 3.83
LINC01816-201ENST00000414141 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.91■■■■□ 3.82
LINC01816-201ENST00000414141 HMGXB3Q12766 1538 aa38.81■■■■□ 3.8
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LINC01816-201ENST00000414141 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.94■■■■□ 3.66
LINC01816-201ENST00000414141 NESP48681 1621 aa37.89■■■■□ 3.66
LINC01816-201ENST00000414141 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.83■■■■□ 3.65
LINC01816-201ENST00000414141 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.83■■■■□ 3.65
LINC01816-201ENST00000414141 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.77■■■■□ 3.64
LINC01816-201ENST00000414141 ERCC6Q03468 1493 aa37.76■■■■□ 3.63
LINC01816-201ENST00000414141 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.68■■■■□ 3.62
LINC01816-201ENST00000414141 CFTRP13569 1480 aa37.64■■■■□ 3.62
LINC01816-201ENST00000414141 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.52■■■■□ 3.6
LINC01816-201ENST00000414141 PRDM2Q13029 1718 aa37.47■■■■□ 3.59
LINC01816-201ENST00000414141 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.39■■■■□ 3.58
LINC01816-201ENST00000414141 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.35■■■■□ 3.57
LINC01816-201ENST00000414141 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.33■■■■□ 3.57
LINC01816-201ENST00000414141 CUX2O14529 1486 aa37.29■■■■□ 3.56
LINC01816-201ENST00000414141 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.25■■■■□ 3.55
LINC01816-201ENST00000414141 WDR62O43379 1518 aa37.11■■■■□ 3.53
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LINC01816-201ENST00000414141 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.83■■■■□ 3.49
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LINC01816-201ENST00000414141 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.46■■■■□ 3.43
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LINC01816-201ENST00000414141 TOP2BQ02880 1626 aa36.38■■■■□ 3.41
LINC01816-201ENST00000414141 SOGA1O94964 1423 aa36.38■■■■□ 3.41
LINC01816-201ENST00000414141 SYNJ1O43426 1573 aa36.34■■■■□ 3.41
LINC01816-201ENST00000414141 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.32■■■■□ 3.41
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LINC01816-201ENST00000414141 WDR97A6NE52 1622 aa36.22■■■■□ 3.39
LINC01816-201ENST00000414141 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.14■■■■□ 3.38
LINC01816-201ENST00000414141 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.13■■■■□ 3.38
LINC01816-201ENST00000414141 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
LINC01816-201ENST00000414141 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.98■■■■□ 3.35
LINC01816-201ENST00000414141 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.97■■■■□ 3.35
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LINC01816-201ENST00000414141 PBRM1Q86U86 1689 aa35.92■■■■□ 3.34
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LINC01816-201ENST00000414141 OSCARQ8IYS5 282 aa35.77■■■■□ 3.32
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LINC01816-201ENST00000414141 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.42■■■■□ 3.26
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LINC01816-201ENST00000414141 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.34■■■■□ 3.25
LINC01816-201ENST00000414141 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.32■■■■□ 3.24
LINC01816-201ENST00000414141 NUP160Q12769 1436 aa35.3■■■■□ 3.24
LINC01816-201ENST00000414141 CEP170Q5SW79 1584 aa35.26■■■■□ 3.24
LINC01816-201ENST00000414141 EEA1Q15075 1411 aa35.22■■■■□ 3.23
LINC01816-201ENST00000414141 ARHGEF11O15085 1522 aa35.16■■■■□ 3.22
LINC01816-201ENST00000414141 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.16■■■■□ 3.22
LINC01816-201ENST00000414141 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.14■■■■□ 3.22
LINC01816-201ENST00000414141 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.14■■■■□ 3.22
LINC01816-201ENST00000414141 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.14■■■■□ 3.22
LINC01816-201ENST00000414141 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.09■■■■□ 3.21
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