Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAB39Q9Y376 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAB39Q9Y376 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAB39Q9Y376 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAB39Q9Y376 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAB39Q9Y376 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAB39Q9Y376 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAB39Q9Y376 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAB39Q9Y376 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAB39Q9Y376 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAB39Q9Y376 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAB39Q9Y376 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAB39Q9Y376 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAB39Q9Y376 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAB39Q9Y376 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAB39Q9Y376 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CAB39Q9Y376 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAB39Q9Y376 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAB39Q9Y376 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAB39Q9Y376 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAB39Q9Y376 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAB39Q9Y376 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAB39Q9Y376 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAB39Q9Y376 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAB39Q9Y376 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAB39Q9Y376 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAB39Q9Y376 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAB39Q9Y376 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAB39Q9Y376 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAB39Q9Y376 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAB39Q9Y376 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAB39Q9Y376 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAB39Q9Y376 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAB39Q9Y376 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAB39Q9Y376 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAB39Q9Y376 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAB39Q9Y376 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAB39Q9Y376 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAB39Q9Y376 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAB39Q9Y376 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAB39Q9Y376 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAB39Q9Y376 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAB39Q9Y376 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAB39Q9Y376 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAB39Q9Y376 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAB39Q9Y376 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAB39Q9Y376 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAB39Q9Y376 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAB39Q9Y376 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CAB39Q9Y376 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAB39Q9Y376 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAB39Q9Y376 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAB39Q9Y376 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAB39Q9Y376 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAB39Q9Y376 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAB39Q9Y376 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAB39Q9Y376 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAB39Q9Y376 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAB39Q9Y376 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAB39Q9Y376 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAB39Q9Y376 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAB39Q9Y376 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAB39Q9Y376 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAB39Q9Y376 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAB39Q9Y376 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAB39Q9Y376 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAB39Q9Y376 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAB39Q9Y376 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAB39Q9Y376 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAB39Q9Y376 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAB39Q9Y376 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAB39Q9Y376 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAB39Q9Y376 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAB39Q9Y376 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAB39Q9Y376 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAB39Q9Y376 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAB39Q9Y376 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAB39Q9Y376 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAB39Q9Y376 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAB39Q9Y376 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAB39Q9Y376 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAB39Q9Y376 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAB39Q9Y376 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAB39Q9Y376 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CAB39Q9Y376 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CAB39Q9Y376 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAB39Q9Y376 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAB39Q9Y376 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAB39Q9Y376 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAB39Q9Y376 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAB39Q9Y376 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAB39Q9Y376 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAB39Q9Y376 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CAB39Q9Y376 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAB39Q9Y376 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAB39Q9Y376 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAB39Q9Y376 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAB39Q9Y376 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAB39Q9Y376 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAB39Q9Y376 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms