Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM8

AP4E1, AP-4 complex subunit epsilon-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4E1Q9UPM8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AP4E1Q9UPM8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AP4E1Q9UPM8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AP4E1Q9UPM8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AP4E1Q9UPM8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
AP4E1Q9UPM8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AP4E1Q9UPM8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
AP4E1Q9UPM8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
AP4E1Q9UPM8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AP4E1Q9UPM8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AP4E1Q9UPM8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AP4E1Q9UPM8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
AP4E1Q9UPM8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
AP4E1Q9UPM8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AP4E1Q9UPM8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
AP4E1Q9UPM8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
AP4E1Q9UPM8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AP4E1Q9UPM8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
AP4E1Q9UPM8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AP4E1Q9UPM8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
AP4E1Q9UPM8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
AP4E1Q9UPM8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
AP4E1Q9UPM8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AP4E1Q9UPM8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AP4E1Q9UPM8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AP4E1Q9UPM8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AP4E1Q9UPM8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
AP4E1Q9UPM8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AP4E1Q9UPM8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AP4E1Q9UPM8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AP4E1Q9UPM8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AP4E1Q9UPM8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AP4E1Q9UPM8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
AP4E1Q9UPM8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
AP4E1Q9UPM8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AP4E1Q9UPM8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AP4E1Q9UPM8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
AP4E1Q9UPM8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AP4E1Q9UPM8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AP4E1Q9UPM8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AP4E1Q9UPM8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AP4E1Q9UPM8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
AP4E1Q9UPM8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
AP4E1Q9UPM8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
AP4E1Q9UPM8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
AP4E1Q9UPM8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
AP4E1Q9UPM8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AP4E1Q9UPM8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AP4E1Q9UPM8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AP4E1Q9UPM8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
AP4E1Q9UPM8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AP4E1Q9UPM8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AP4E1Q9UPM8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AP4E1Q9UPM8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AP4E1Q9UPM8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
AP4E1Q9UPM8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AP4E1Q9UPM8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
AP4E1Q9UPM8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AP4E1Q9UPM8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AP4E1Q9UPM8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AP4E1Q9UPM8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AP4E1Q9UPM8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AP4E1Q9UPM8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AP4E1Q9UPM8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AP4E1Q9UPM8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AP4E1Q9UPM8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
AP4E1Q9UPM8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
AP4E1Q9UPM8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AP4E1Q9UPM8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AP4E1Q9UPM8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AP4E1Q9UPM8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AP4E1Q9UPM8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AP4E1Q9UPM8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AP4E1Q9UPM8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AP4E1Q9UPM8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AP4E1Q9UPM8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AP4E1Q9UPM8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AP4E1Q9UPM8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AP4E1Q9UPM8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AP4E1Q9UPM8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AP4E1Q9UPM8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AP4E1Q9UPM8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AP4E1Q9UPM8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AP4E1Q9UPM8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AP4E1Q9UPM8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AP4E1Q9UPM8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
AP4E1Q9UPM8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AP4E1Q9UPM8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AP4E1Q9UPM8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AP4E1Q9UPM8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AP4E1Q9UPM8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AP4E1Q9UPM8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AP4E1Q9UPM8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AP4E1Q9UPM8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
AP4E1Q9UPM8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
AP4E1Q9UPM8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AP4E1Q9UPM8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AP4E1Q9UPM8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AP4E1Q9UPM8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AP4E1Q9UPM8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.2 ms