Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS6

KCNS2, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 2, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS2Q9ULS6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNS2Q9ULS6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNS2Q9ULS6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNS2Q9ULS6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNS2Q9ULS6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNS2Q9ULS6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNS2Q9ULS6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNS2Q9ULS6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNS2Q9ULS6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNS2Q9ULS6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNS2Q9ULS6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNS2Q9ULS6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNS2Q9ULS6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNS2Q9ULS6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNS2Q9ULS6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNS2Q9ULS6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNS2Q9ULS6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNS2Q9ULS6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNS2Q9ULS6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNS2Q9ULS6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNS2Q9ULS6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNS2Q9ULS6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNS2Q9ULS6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNS2Q9ULS6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNS2Q9ULS6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNS2Q9ULS6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNS2Q9ULS6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNS2Q9ULS6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNS2Q9ULS6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNS2Q9ULS6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNS2Q9ULS6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNS2Q9ULS6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNS2Q9ULS6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNS2Q9ULS6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNS2Q9ULS6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNS2Q9ULS6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNS2Q9ULS6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNS2Q9ULS6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNS2Q9ULS6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNS2Q9ULS6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNS2Q9ULS6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNS2Q9ULS6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNS2Q9ULS6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNS2Q9ULS6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNS2Q9ULS6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNS2Q9ULS6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNS2Q9ULS6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNS2Q9ULS6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNS2Q9ULS6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNS2Q9ULS6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNS2Q9ULS6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNS2Q9ULS6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNS2Q9ULS6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNS2Q9ULS6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNS2Q9ULS6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNS2Q9ULS6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNS2Q9ULS6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNS2Q9ULS6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNS2Q9ULS6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNS2Q9ULS6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNS2Q9ULS6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNS2Q9ULS6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNS2Q9ULS6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNS2Q9ULS6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNS2Q9ULS6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNS2Q9ULS6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNS2Q9ULS6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNS2Q9ULS6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNS2Q9ULS6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNS2Q9ULS6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNS2Q9ULS6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNS2Q9ULS6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KCNS2Q9ULS6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNS2Q9ULS6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNS2Q9ULS6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNS2Q9ULS6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNS2Q9ULS6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNS2Q9ULS6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNS2Q9ULS6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNS2Q9ULS6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNS2Q9ULS6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNS2Q9ULS6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNS2Q9ULS6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNS2Q9ULS6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNS2Q9ULS6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNS2Q9ULS6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNS2Q9ULS6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNS2Q9ULS6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNS2Q9ULS6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNS2Q9ULS6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNS2Q9ULS6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNS2Q9ULS6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNS2Q9ULS6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNS2Q9ULS6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNS2Q9ULS6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNS2Q9ULS6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNS2Q9ULS6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNS2Q9ULS6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNS2Q9ULS6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNS2Q9ULS6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms