Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW7

ZNF229, Zinc finger protein 229, humanhuman

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF229Q9UJW7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF229Q9UJW7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF229Q9UJW7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF229Q9UJW7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF229Q9UJW7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF229Q9UJW7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF229Q9UJW7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF229Q9UJW7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF229Q9UJW7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF229Q9UJW7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF229Q9UJW7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF229Q9UJW7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF229Q9UJW7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF229Q9UJW7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF229Q9UJW7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF229Q9UJW7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF229Q9UJW7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF229Q9UJW7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF229Q9UJW7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF229Q9UJW7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF229Q9UJW7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF229Q9UJW7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF229Q9UJW7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF229Q9UJW7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF229Q9UJW7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF229Q9UJW7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF229Q9UJW7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF229Q9UJW7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF229Q9UJW7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF229Q9UJW7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF229Q9UJW7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF229Q9UJW7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF229Q9UJW7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF229Q9UJW7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF229Q9UJW7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF229Q9UJW7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF229Q9UJW7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF229Q9UJW7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF229Q9UJW7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF229Q9UJW7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF229Q9UJW7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF229Q9UJW7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF229Q9UJW7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZNF229Q9UJW7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF229Q9UJW7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF229Q9UJW7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF229Q9UJW7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF229Q9UJW7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF229Q9UJW7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF229Q9UJW7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF229Q9UJW7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF229Q9UJW7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF229Q9UJW7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF229Q9UJW7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF229Q9UJW7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF229Q9UJW7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF229Q9UJW7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF229Q9UJW7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF229Q9UJW7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF229Q9UJW7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF229Q9UJW7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF229Q9UJW7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF229Q9UJW7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF229Q9UJW7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF229Q9UJW7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF229Q9UJW7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF229Q9UJW7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF229Q9UJW7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF229Q9UJW7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF229Q9UJW7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF229Q9UJW7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF229Q9UJW7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF229Q9UJW7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF229Q9UJW7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF229Q9UJW7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF229Q9UJW7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF229Q9UJW7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF229Q9UJW7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF229Q9UJW7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF229Q9UJW7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF229Q9UJW7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF229Q9UJW7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF229Q9UJW7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF229Q9UJW7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF229Q9UJW7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF229Q9UJW7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF229Q9UJW7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF229Q9UJW7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF229Q9UJW7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF229Q9UJW7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF229Q9UJW7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF229Q9UJW7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF229Q9UJW7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF229Q9UJW7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF229Q9UJW7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF229Q9UJW7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF229Q9UJW7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF229Q9UJW7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF229Q9UJW7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF229Q9UJW7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms