Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHY1

NRBP1, Nuclear receptor-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRBP1Q9UHY1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NRBP1Q9UHY1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NRBP1Q9UHY1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NRBP1Q9UHY1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NRBP1Q9UHY1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NRBP1Q9UHY1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NRBP1Q9UHY1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
NRBP1Q9UHY1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NRBP1Q9UHY1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
NRBP1Q9UHY1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NRBP1Q9UHY1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NRBP1Q9UHY1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NRBP1Q9UHY1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NRBP1Q9UHY1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NRBP1Q9UHY1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NRBP1Q9UHY1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NRBP1Q9UHY1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NRBP1Q9UHY1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NRBP1Q9UHY1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NRBP1Q9UHY1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NRBP1Q9UHY1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NRBP1Q9UHY1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NRBP1Q9UHY1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NRBP1Q9UHY1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NRBP1Q9UHY1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
NRBP1Q9UHY1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NRBP1Q9UHY1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NRBP1Q9UHY1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NRBP1Q9UHY1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NRBP1Q9UHY1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NRBP1Q9UHY1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NRBP1Q9UHY1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NRBP1Q9UHY1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NRBP1Q9UHY1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
NRBP1Q9UHY1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NRBP1Q9UHY1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NRBP1Q9UHY1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
NRBP1Q9UHY1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NRBP1Q9UHY1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
NRBP1Q9UHY1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
NRBP1Q9UHY1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NRBP1Q9UHY1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NRBP1Q9UHY1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NRBP1Q9UHY1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NRBP1Q9UHY1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
NRBP1Q9UHY1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NRBP1Q9UHY1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NRBP1Q9UHY1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NRBP1Q9UHY1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NRBP1Q9UHY1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NRBP1Q9UHY1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NRBP1Q9UHY1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NRBP1Q9UHY1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NRBP1Q9UHY1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NRBP1Q9UHY1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NRBP1Q9UHY1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NRBP1Q9UHY1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NRBP1Q9UHY1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NRBP1Q9UHY1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NRBP1Q9UHY1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NRBP1Q9UHY1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms