Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCF20Q9UGU0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TCF20Q9UGU0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCF20Q9UGU0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCF20Q9UGU0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCF20Q9UGU0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCF20Q9UGU0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCF20Q9UGU0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCF20Q9UGU0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCF20Q9UGU0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCF20Q9UGU0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCF20Q9UGU0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCF20Q9UGU0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCF20Q9UGU0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TCF20Q9UGU0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCF20Q9UGU0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TCF20Q9UGU0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCF20Q9UGU0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCF20Q9UGU0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCF20Q9UGU0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCF20Q9UGU0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCF20Q9UGU0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCF20Q9UGU0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCF20Q9UGU0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCF20Q9UGU0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCF20Q9UGU0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCF20Q9UGU0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCF20Q9UGU0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCF20Q9UGU0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TCF20Q9UGU0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCF20Q9UGU0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCF20Q9UGU0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TCF20Q9UGU0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCF20Q9UGU0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCF20Q9UGU0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TCF20Q9UGU0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCF20Q9UGU0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCF20Q9UGU0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCF20Q9UGU0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TCF20Q9UGU0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCF20Q9UGU0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCF20Q9UGU0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCF20Q9UGU0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TCF20Q9UGU0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TCF20Q9UGU0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TCF20Q9UGU0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TCF20Q9UGU0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCF20Q9UGU0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCF20Q9UGU0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCF20Q9UGU0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCF20Q9UGU0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCF20Q9UGU0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCF20Q9UGU0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCF20Q9UGU0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TCF20Q9UGU0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TCF20Q9UGU0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TCF20Q9UGU0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TCF20Q9UGU0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCF20Q9UGU0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCF20Q9UGU0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCF20Q9UGU0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TCF20Q9UGU0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TCF20Q9UGU0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TCF20Q9UGU0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TCF20Q9UGU0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TCF20Q9UGU0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCF20Q9UGU0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCF20Q9UGU0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCF20Q9UGU0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCF20Q9UGU0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCF20Q9UGU0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCF20Q9UGU0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCF20Q9UGU0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCF20Q9UGU0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCF20Q9UGU0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCF20Q9UGU0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TCF20Q9UGU0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TCF20Q9UGU0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TCF20Q9UGU0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TCF20Q9UGU0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TCF20Q9UGU0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TCF20Q9UGU0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TCF20Q9UGU0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TCF20Q9UGU0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TCF20Q9UGU0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TCF20Q9UGU0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TCF20Q9UGU0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TCF20Q9UGU0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TCF20Q9UGU0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TCF20Q9UGU0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TCF20Q9UGU0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TCF20Q9UGU0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TCF20Q9UGU0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TCF20Q9UGU0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TCF20Q9UGU0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TCF20Q9UGU0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TCF20Q9UGU0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TCF20Q9UGU0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TCF20Q9UGU0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TCF20Q9UGU0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms