Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNIH4Q9P003 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNIH4Q9P003 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNIH4Q9P003 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNIH4Q9P003 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNIH4Q9P003 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNIH4Q9P003 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CNIH4Q9P003 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNIH4Q9P003 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNIH4Q9P003 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNIH4Q9P003 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNIH4Q9P003 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CNIH4Q9P003 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNIH4Q9P003 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNIH4Q9P003 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNIH4Q9P003 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNIH4Q9P003 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNIH4Q9P003 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNIH4Q9P003 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNIH4Q9P003 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNIH4Q9P003 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNIH4Q9P003 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNIH4Q9P003 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNIH4Q9P003 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNIH4Q9P003 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNIH4Q9P003 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNIH4Q9P003 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNIH4Q9P003 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNIH4Q9P003 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNIH4Q9P003 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNIH4Q9P003 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNIH4Q9P003 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNIH4Q9P003 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNIH4Q9P003 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNIH4Q9P003 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNIH4Q9P003 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNIH4Q9P003 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNIH4Q9P003 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNIH4Q9P003 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNIH4Q9P003 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNIH4Q9P003 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNIH4Q9P003 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNIH4Q9P003 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNIH4Q9P003 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNIH4Q9P003 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNIH4Q9P003 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNIH4Q9P003 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNIH4Q9P003 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNIH4Q9P003 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNIH4Q9P003 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNIH4Q9P003 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNIH4Q9P003 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNIH4Q9P003 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNIH4Q9P003 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNIH4Q9P003 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNIH4Q9P003 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNIH4Q9P003 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNIH4Q9P003 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNIH4Q9P003 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNIH4Q9P003 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNIH4Q9P003 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNIH4Q9P003 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNIH4Q9P003 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNIH4Q9P003 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNIH4Q9P003 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNIH4Q9P003 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNIH4Q9P003 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNIH4Q9P003 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNIH4Q9P003 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNIH4Q9P003 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNIH4Q9P003 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNIH4Q9P003 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CNIH4Q9P003 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNIH4Q9P003 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNIH4Q9P003 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNIH4Q9P003 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNIH4Q9P003 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNIH4Q9P003 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNIH4Q9P003 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CNIH4Q9P003 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNIH4Q9P003 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNIH4Q9P003 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNIH4Q9P003 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNIH4Q9P003 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNIH4Q9P003 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNIH4Q9P003 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNIH4Q9P003 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNIH4Q9P003 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNIH4Q9P003 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNIH4Q9P003 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNIH4Q9P003 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNIH4Q9P003 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNIH4Q9P003 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNIH4Q9P003 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNIH4Q9P003 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNIH4Q9P003 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNIH4Q9P003 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNIH4Q9P003 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNIH4Q9P003 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNIH4Q9P003 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms