Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU0

FLRT3, Leucine-rich repeat transmembrane protein FLRT3, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLRT3Q9NZU0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FLRT3Q9NZU0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FLRT3Q9NZU0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FLRT3Q9NZU0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FLRT3Q9NZU0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FLRT3Q9NZU0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FLRT3Q9NZU0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FLRT3Q9NZU0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FLRT3Q9NZU0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FLRT3Q9NZU0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FLRT3Q9NZU0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FLRT3Q9NZU0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FLRT3Q9NZU0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FLRT3Q9NZU0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FLRT3Q9NZU0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FLRT3Q9NZU0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FLRT3Q9NZU0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FLRT3Q9NZU0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FLRT3Q9NZU0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FLRT3Q9NZU0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FLRT3Q9NZU0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FLRT3Q9NZU0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FLRT3Q9NZU0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FLRT3Q9NZU0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FLRT3Q9NZU0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FLRT3Q9NZU0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FLRT3Q9NZU0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FLRT3Q9NZU0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FLRT3Q9NZU0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FLRT3Q9NZU0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FLRT3Q9NZU0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FLRT3Q9NZU0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FLRT3Q9NZU0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FLRT3Q9NZU0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FLRT3Q9NZU0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FLRT3Q9NZU0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FLRT3Q9NZU0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FLRT3Q9NZU0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FLRT3Q9NZU0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FLRT3Q9NZU0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FLRT3Q9NZU0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FLRT3Q9NZU0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FLRT3Q9NZU0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FLRT3Q9NZU0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FLRT3Q9NZU0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FLRT3Q9NZU0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FLRT3Q9NZU0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FLRT3Q9NZU0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FLRT3Q9NZU0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FLRT3Q9NZU0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FLRT3Q9NZU0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FLRT3Q9NZU0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FLRT3Q9NZU0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FLRT3Q9NZU0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FLRT3Q9NZU0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FLRT3Q9NZU0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FLRT3Q9NZU0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FLRT3Q9NZU0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FLRT3Q9NZU0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FLRT3Q9NZU0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FLRT3Q9NZU0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FLRT3Q9NZU0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FLRT3Q9NZU0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FLRT3Q9NZU0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FLRT3Q9NZU0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FLRT3Q9NZU0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FLRT3Q9NZU0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FLRT3Q9NZU0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FLRT3Q9NZU0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FLRT3Q9NZU0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLRT3Q9NZU0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLRT3Q9NZU0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLRT3Q9NZU0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLRT3Q9NZU0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLRT3Q9NZU0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLRT3Q9NZU0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLRT3Q9NZU0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLRT3Q9NZU0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FLRT3Q9NZU0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FLRT3Q9NZU0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FLRT3Q9NZU0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FLRT3Q9NZU0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FLRT3Q9NZU0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FLRT3Q9NZU0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FLRT3Q9NZU0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FLRT3Q9NZU0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FLRT3Q9NZU0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FLRT3Q9NZU0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FLRT3Q9NZU0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FLRT3Q9NZU0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FLRT3Q9NZU0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FLRT3Q9NZU0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FLRT3Q9NZU0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FLRT3Q9NZU0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FLRT3Q9NZU0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FLRT3Q9NZU0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FLRT3Q9NZU0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FLRT3Q9NZU0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FLRT3Q9NZU0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FLRT3Q9NZU0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms