Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC2

TREM2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM2Q9NZC2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TREM2Q9NZC2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TREM2Q9NZC2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TREM2Q9NZC2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TREM2Q9NZC2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TREM2Q9NZC2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TREM2Q9NZC2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREM2Q9NZC2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREM2Q9NZC2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREM2Q9NZC2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREM2Q9NZC2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREM2Q9NZC2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREM2Q9NZC2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREM2Q9NZC2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREM2Q9NZC2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TREM2Q9NZC2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TREM2Q9NZC2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TREM2Q9NZC2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TREM2Q9NZC2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TREM2Q9NZC2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TREM2Q9NZC2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TREM2Q9NZC2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TREM2Q9NZC2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREM2Q9NZC2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREM2Q9NZC2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREM2Q9NZC2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREM2Q9NZC2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TREM2Q9NZC2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREM2Q9NZC2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREM2Q9NZC2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREM2Q9NZC2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREM2Q9NZC2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TREM2Q9NZC2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREM2Q9NZC2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREM2Q9NZC2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TREM2Q9NZC2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TREM2Q9NZC2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TREM2Q9NZC2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TREM2Q9NZC2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TREM2Q9NZC2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TREM2Q9NZC2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TREM2Q9NZC2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREM2Q9NZC2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREM2Q9NZC2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREM2Q9NZC2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREM2Q9NZC2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREM2Q9NZC2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREM2Q9NZC2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREM2Q9NZC2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREM2Q9NZC2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREM2Q9NZC2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREM2Q9NZC2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREM2Q9NZC2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREM2Q9NZC2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TREM2Q9NZC2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREM2Q9NZC2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREM2Q9NZC2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREM2Q9NZC2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREM2Q9NZC2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREM2Q9NZC2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREM2Q9NZC2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREM2Q9NZC2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREM2Q9NZC2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREM2Q9NZC2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREM2Q9NZC2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREM2Q9NZC2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREM2Q9NZC2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREM2Q9NZC2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREM2Q9NZC2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREM2Q9NZC2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREM2Q9NZC2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TREM2Q9NZC2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREM2Q9NZC2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TREM2Q9NZC2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TREM2Q9NZC2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TREM2Q9NZC2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TREM2Q9NZC2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TREM2Q9NZC2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TREM2Q9NZC2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TREM2Q9NZC2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREM2Q9NZC2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREM2Q9NZC2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TREM2Q9NZC2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREM2Q9NZC2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREM2Q9NZC2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREM2Q9NZC2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREM2Q9NZC2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TREM2Q9NZC2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TREM2Q9NZC2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TREM2Q9NZC2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TREM2Q9NZC2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TREM2Q9NZC2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TREM2Q9NZC2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TREM2Q9NZC2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TREM2Q9NZC2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TREM2Q9NZC2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TREM2Q9NZC2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TREM2Q9NZC2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TREM2Q9NZC2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TREM2Q9NZC2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms