Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUC0

SERTAD4, SERTA domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERTAD4Q9NUC0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SERTAD4Q9NUC0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SERTAD4Q9NUC0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SERTAD4Q9NUC0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SERTAD4Q9NUC0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SERTAD4Q9NUC0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SERTAD4Q9NUC0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SERTAD4Q9NUC0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SERTAD4Q9NUC0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERTAD4Q9NUC0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERTAD4Q9NUC0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERTAD4Q9NUC0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SERTAD4Q9NUC0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SERTAD4Q9NUC0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SERTAD4Q9NUC0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SERTAD4Q9NUC0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SERTAD4Q9NUC0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SERTAD4Q9NUC0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SERTAD4Q9NUC0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERTAD4Q9NUC0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERTAD4Q9NUC0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERTAD4Q9NUC0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERTAD4Q9NUC0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERTAD4Q9NUC0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERTAD4Q9NUC0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERTAD4Q9NUC0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERTAD4Q9NUC0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERTAD4Q9NUC0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERTAD4Q9NUC0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SERTAD4Q9NUC0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SERTAD4Q9NUC0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SERTAD4Q9NUC0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SERTAD4Q9NUC0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SERTAD4Q9NUC0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SERTAD4Q9NUC0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SERTAD4Q9NUC0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SERTAD4Q9NUC0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SERTAD4Q9NUC0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SERTAD4Q9NUC0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SERTAD4Q9NUC0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SERTAD4Q9NUC0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SERTAD4Q9NUC0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SERTAD4Q9NUC0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SERTAD4Q9NUC0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SERTAD4Q9NUC0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SERTAD4Q9NUC0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SERTAD4Q9NUC0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SERTAD4Q9NUC0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERTAD4Q9NUC0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERTAD4Q9NUC0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERTAD4Q9NUC0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERTAD4Q9NUC0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERTAD4Q9NUC0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERTAD4Q9NUC0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERTAD4Q9NUC0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERTAD4Q9NUC0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SERTAD4Q9NUC0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SERTAD4Q9NUC0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SERTAD4Q9NUC0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SERTAD4Q9NUC0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SERTAD4Q9NUC0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SERTAD4Q9NUC0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SERTAD4Q9NUC0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERTAD4Q9NUC0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERTAD4Q9NUC0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERTAD4Q9NUC0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERTAD4Q9NUC0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERTAD4Q9NUC0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERTAD4Q9NUC0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SERTAD4Q9NUC0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SERTAD4Q9NUC0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SERTAD4Q9NUC0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SERTAD4Q9NUC0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SERTAD4Q9NUC0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SERTAD4Q9NUC0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SERTAD4Q9NUC0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERTAD4Q9NUC0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERTAD4Q9NUC0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERTAD4Q9NUC0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERTAD4Q9NUC0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SERTAD4Q9NUC0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SERTAD4Q9NUC0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERTAD4Q9NUC0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERTAD4Q9NUC0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SERTAD4Q9NUC0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SERTAD4Q9NUC0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SERTAD4Q9NUC0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SERTAD4Q9NUC0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SERTAD4Q9NUC0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SERTAD4Q9NUC0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SERTAD4Q9NUC0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SERTAD4Q9NUC0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SERTAD4Q9NUC0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SERTAD4Q9NUC0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SERTAD4Q9NUC0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SERTAD4Q9NUC0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SERTAD4Q9NUC0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SERTAD4Q9NUC0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SERTAD4Q9NUC0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SERTAD4Q9NUC0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms