Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNPLA3Q9NST1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNPLA3Q9NST1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PNPLA3Q9NST1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PNPLA3Q9NST1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PNPLA3Q9NST1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PNPLA3Q9NST1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PNPLA3Q9NST1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNPLA3Q9NST1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNPLA3Q9NST1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNPLA3Q9NST1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNPLA3Q9NST1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNPLA3Q9NST1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNPLA3Q9NST1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNPLA3Q9NST1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNPLA3Q9NST1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNPLA3Q9NST1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNPLA3Q9NST1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNPLA3Q9NST1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PNPLA3Q9NST1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNPLA3Q9NST1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNPLA3Q9NST1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNPLA3Q9NST1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNPLA3Q9NST1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNPLA3Q9NST1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNPLA3Q9NST1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNPLA3Q9NST1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNPLA3Q9NST1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNPLA3Q9NST1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNPLA3Q9NST1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNPLA3Q9NST1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNPLA3Q9NST1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNPLA3Q9NST1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PNPLA3Q9NST1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNPLA3Q9NST1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNPLA3Q9NST1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNPLA3Q9NST1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNPLA3Q9NST1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNPLA3Q9NST1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNPLA3Q9NST1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNPLA3Q9NST1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNPLA3Q9NST1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNPLA3Q9NST1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNPLA3Q9NST1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNPLA3Q9NST1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PNPLA3Q9NST1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNPLA3Q9NST1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNPLA3Q9NST1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNPLA3Q9NST1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNPLA3Q9NST1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNPLA3Q9NST1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNPLA3Q9NST1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNPLA3Q9NST1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNPLA3Q9NST1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PNPLA3Q9NST1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNPLA3Q9NST1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNPLA3Q9NST1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNPLA3Q9NST1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNPLA3Q9NST1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNPLA3Q9NST1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNPLA3Q9NST1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNPLA3Q9NST1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNPLA3Q9NST1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PNPLA3Q9NST1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNPLA3Q9NST1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNPLA3Q9NST1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNPLA3Q9NST1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNPLA3Q9NST1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNPLA3Q9NST1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNPLA3Q9NST1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNPLA3Q9NST1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNPLA3Q9NST1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNPLA3Q9NST1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNPLA3Q9NST1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNPLA3Q9NST1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNPLA3Q9NST1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNPLA3Q9NST1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNPLA3Q9NST1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PNPLA3Q9NST1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PNPLA3Q9NST1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PNPLA3Q9NST1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PNPLA3Q9NST1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PNPLA3Q9NST1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PNPLA3Q9NST1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PNPLA3Q9NST1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNPLA3Q9NST1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNPLA3Q9NST1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNPLA3Q9NST1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNPLA3Q9NST1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNPLA3Q9NST1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNPLA3Q9NST1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNPLA3Q9NST1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNPLA3Q9NST1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNPLA3Q9NST1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNPLA3Q9NST1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNPLA3Q9NST1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNPLA3Q9NST1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNPLA3Q9NST1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNPLA3Q9NST1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PNPLA3Q9NST1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms