Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ50

MRPL40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL40Q9NQ50 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MRPL40Q9NQ50 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRPL40Q9NQ50 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRPL40Q9NQ50 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRPL40Q9NQ50 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRPL40Q9NQ50 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MRPL40Q9NQ50 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MRPL40Q9NQ50 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
MRPL40Q9NQ50 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
MRPL40Q9NQ50 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MRPL40Q9NQ50 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MRPL40Q9NQ50 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MRPL40Q9NQ50 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
MRPL40Q9NQ50 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MRPL40Q9NQ50 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MRPL40Q9NQ50 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MRPL40Q9NQ50 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MRPL40Q9NQ50 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MRPL40Q9NQ50 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MRPL40Q9NQ50 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MRPL40Q9NQ50 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MRPL40Q9NQ50 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MRPL40Q9NQ50 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MRPL40Q9NQ50 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MRPL40Q9NQ50 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MRPL40Q9NQ50 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MRPL40Q9NQ50 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MRPL40Q9NQ50 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MRPL40Q9NQ50 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MRPL40Q9NQ50 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MRPL40Q9NQ50 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MRPL40Q9NQ50 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MRPL40Q9NQ50 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MRPL40Q9NQ50 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MRPL40Q9NQ50 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MRPL40Q9NQ50 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MRPL40Q9NQ50 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MRPL40Q9NQ50 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MRPL40Q9NQ50 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MRPL40Q9NQ50 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MRPL40Q9NQ50 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MRPL40Q9NQ50 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRPL40Q9NQ50 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRPL40Q9NQ50 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPL40Q9NQ50 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPL40Q9NQ50 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPL40Q9NQ50 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MRPL40Q9NQ50 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MRPL40Q9NQ50 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MRPL40Q9NQ50 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MRPL40Q9NQ50 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MRPL40Q9NQ50 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MRPL40Q9NQ50 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MRPL40Q9NQ50 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MRPL40Q9NQ50 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MRPL40Q9NQ50 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MRPL40Q9NQ50 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MRPL40Q9NQ50 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MRPL40Q9NQ50 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MRPL40Q9NQ50 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRPL40Q9NQ50 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRPL40Q9NQ50 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MRPL40Q9NQ50 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRPL40Q9NQ50 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRPL40Q9NQ50 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRPL40Q9NQ50 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MRPL40Q9NQ50 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MRPL40Q9NQ50 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MRPL40Q9NQ50 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MRPL40Q9NQ50 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MRPL40Q9NQ50 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
MRPL40Q9NQ50 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MRPL40Q9NQ50 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MRPL40Q9NQ50 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MRPL40Q9NQ50 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MRPL40Q9NQ50 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MRPL40Q9NQ50 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MRPL40Q9NQ50 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MRPL40Q9NQ50 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
MRPL40Q9NQ50 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MRPL40Q9NQ50 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MRPL40Q9NQ50 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPL40Q9NQ50 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPL40Q9NQ50 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPL40Q9NQ50 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPL40Q9NQ50 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPL40Q9NQ50 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPL40Q9NQ50 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPL40Q9NQ50 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPL40Q9NQ50 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRPL40Q9NQ50 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRPL40Q9NQ50 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MRPL40Q9NQ50 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRPL40Q9NQ50 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRPL40Q9NQ50 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRPL40Q9NQ50 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRPL40Q9NQ50 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRPL40Q9NQ50 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRPL40Q9NQ50 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRPL40Q9NQ50 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms